定量方法包括相对定量和定量，两者的重要差异在于相对定量的结果是差异性的结果，涉及比较；而定量的结果是一个具体数值，对于基因表达量而言是基因的拷贝数，不涉及任何比较。相对定量首先需要确定一个内参基因，内参基因作用有检测样本材料中RNA是否降解、纠正样本加样的差异、校正cDNA合成速率差异及校正PCR抑制剂的影响，其本质作用是利用内参基因的Ct值对目的基因的Ct值进行均一化处理，常用的内参基因包括DH、β-actin、18S rRNA，使用的时候需要注意其序列必须是物种本身的特异序列，虽然其比较保守，但不同物种也会存在碱基差别。另外，相对定量需要确定参照物，因为涉及比较，参照物选择不同，所得的定量...

实时荧光定量PCR（Real-time fluorescence quantitative PCR，qPCR）通过在普通 PCR 反应体系中加入了荧光标记探针或荧光染料，利用荧光信号的变化实时检测PCR扩增反应中每一个循环扩增产物变化。通过荧光强度变化监测产物量的变化，从而得到一条荧光扩增曲线图。具有专一性更高、可实时监控、可重复精确定量等优势。qPCR的种类根据qPCR的化学发光原理一般分为2大类：一类是探针法，利用与靶序列特异杂交的探针来指示扩增产物的增加；一类是基于SYBR Green I 的染料法，通过荧光染料来指示产物的增加。QPCR用于基因表达研究、转基因研究，药物疗效考核、病原体...

qPCR和dPCR:研究人员已经通过两种方式克服了定量PCR分析的挑战：实时定量PCR(qPCR)和数字PCR(dPCR)。qPCR主要使用插入染料或荧光探针(例如TaqMan)。通过监测PCR期间的荧光强度，可以比较多个样品的DNA水平。数字PCR(dPCR)的基本工作原理很简单。先将样品分为多个PCR反应，每个反应多包含一个模板。然后通过对阳性和阴性反应进行计数来确定初始样品中模板分子的数量。尽管qPCR和dPCR都能够定量样品中的核酸，但它们有一个重要的区别。qPCR只能实现相对定量(例如，样品A的目标序列是样品B的目标序列的两倍)，除非使用此标准生成标准曲线。数字PCR本身是定量的，不...

PCR，qPCR，dPCR分别是什么?有什么区别?PCR，qPCR，dPCR分别是什么吗?这些东西，在生物行业里见的比较多，我们生物行业的从业人员懂得应该多一些。PCR技术，在二十世纪八十年代被发明。现在DNA扩增已成为生物学研究的基础。96孔板供应天津本生告诉大家，在过去的三十年中，这项经典技术已得到不断改进，以解决研究中的新问题和新需求。从经典PCR，实时定量PCR到当前的数字PCR，PCR技术在不断变化，但从未消失。如今，PCR技术已经从实验室中分离出来，在遗传鉴定和疾病诊断中发挥了巨大作用，并且在日益广阔的领域中具有新的生命力。SYBR Green I 是一种结合于所有双链DNA（ds...

PCR：Polymerase chain reaction. 是体外模拟生物的DNA 复制。需要DNA 聚合酶，DNA 模板，两端引物，脱氧核苷酸dNTPs( dATP, ACTP, dGTP, dTTP),以及适当的缓冲体系。PCR 产物的增长形式为２N (如果各种试剂和外部所加条件均理想化，N 是循环数)。实际中，扩增效率不为100％。Real time PCR 是定量PCR 的一种，当然是在PCR 的基础上发展出来的。（普通）PCR 包含很多因素，属性，如：试剂，温度，循环数，程序，PCR 产物（扩增子，amplicon）的量，扩增曲线（扩增子累积曲线），掺错率，扩增子长度。一般来说，人...

PCR反应需要五种关键试剂：PCR模板：也称为模板DNA，需要常规的试剂盒进行提取。如基因组DNA（gDNA），cDNA和质粒DNA。DNA聚合酶：所有PCR反应都需要可在高温下工作的DNA聚合酶。Taq聚合酶是一种常用的酶，它可以在70°C时以60个碱基/秒的速率整合核苷酸，并可以扩增高达5kb的模板，使其适用于无特殊要求的标准PCR。引物：DNA聚合酶需要短序列的核苷酸，以指示它们需要在哪里开始扩增。在PCR中，这些序列称为引物，是单链DNA的短片段（约15-30个碱基）。脱氧核苷酸三磷酸（dNTPs）：是合成DNA新链的基础，包括四个基本DNA核苷酸（dATP，dCTP，dGTP和dTT...

RT-PCR是利用逆转录酶通过随机引物或Oligo（dT），或者特异性下游引物将mRNA反转成cDNA，再以cDNA作为PCR的模板进行后续反应。现今已有一些商用的一步法RT-PCR试剂盒，相比于普通PCR，其检测步骤在变性前增加了约30分钟（50℃）的逆转录过程，不需要单独进行逆转录过程，操作更为简单。qPCR是在普通PCR基础上，利用荧光标记和光学检测技术对其的改进，是对核酸定性和定量检测的技术，也是现今主流的核酸检测断技术之一，并且常作为金标准方法与研发的新方法相比较。qPCR在原有PCR基础上与荧光检测方法结合，实现了PCR从定性到定量的飞跃，具有灵敏度高、特异性强的优点，还有效规避了...

q225 加样孔板侧壁和金属热块能够严密贴合，使液体样品迅速达到设定温度，从而减少实验时间。右上为 q225 在一次40 个循环的常规qPCR 实验内加热块温度变化情况，在整个实验过程中金属块升降温迅速且温度稳定，不受机器本身随实验时间延长而内部背景温度上升的影响。qPCR 反应所需时间很大程度上取决于对反应溶液进行变温所需要的时间，而这一过程又受到加热块升降温速度和液体升降温速度两方面的影响。q225 所使用的热循环系统峰值变温速率可达4°C/s，更重要的是，经过精密设计的加热块能够很大程度地贴合孔板形状，实现高效的热传导，使得在加热块达到预定温度后反应溶液也能在短时间内达到相同温度，反应溶...

定量首先需要建立Ct值和拷贝数之间的线性关系，即标准曲线，标曲需要由标准品生成，标准品中基因序列要与待测样品中基因序列一致，从而保证引物在两者中扩增效率完全相同，标准品来源可以是质粒，纯化的PCR产物或者基因组DNA等。标准品在加样时需要注意体积比较好大于2微升，以减少标曲误差，标曲是由不同梯度标准品生成，每个标准品梯度建立Ct值与拷贝数对数值之间的联系，落在标曲上的梯度点比较好有5个及以上，至少3个点。标准品和待测样品同时反应，将待测样品检测的Ct值代入标曲后即可换算出待测样品中基因的拷贝数。荧光检测系统可接收荧光信号，每扩增一条DNA链，就有一个荧光分子形成，荧光信号累积和PCR产物形成是...

dPCR比qPCR准确度与精密度高。qPCR的效率会受到很多因素影响。例如：试剂保存不当导致部分样本降解、标准曲线偏斜导致CT值受到影响。dPCR 将样本分成若干小的 PCR 反应分区，可实现单分子检测，避免模板间的竞争效应的影响，可提高目的序列的检测准确度。由于dPCR较少受到扩增效率的影响，因此具有更高的准确度与精密度。qPCR面对小的差异较弱，dPCR则可识别差异较小的拷贝数。dPCR比qPCR重复性和通用性高。qPCR只能实现相对定量，即必须使用标准品生成标准曲线，才能进行定量。dPCR是定量，不需要利用标准品绘制标准曲线，也不依赖荧光信号到达设定阈值时所经历的循环数，直接计算样品中目...

交联和裂解——稳定复合物并分离核组分:第一步对时间要求严格并且需要优化。体内共价交联稳定蛋白质-DNA相互作用并于特定时间点进行分析。通常采用甲醛交联，加入甘氨酸以终止反应。交联剂渗透到完整细胞中并将蛋白质-DNA复合物锁定在一起从而进行分析。交联剂在整个过程中保持复合物稳定，但其作用必须是可逆的才能用于ChIP。一些非常稳定的蛋白质-DNA相互作用则不需要交联。接下来，使用裂解液透化细胞膜，释放细胞组分，然后蛋白质-DNA复合物变得可溶。去除细胞溶质蛋白以减少背景信号并增加灵敏度。注意：此时可以停止ChIP测定。 经过交联，淬灭和洗涤细胞沉淀后，将裂解物于-80℃储存。QPCR用于基因表达研...

TaqMan 方法的优点：需要在探针和目标分子（靶点）之间发生特异性的水解（杂交），方可生成荧光信号。可使用明显不同的报告基因染料标记探针，在一个反应管内扩增并检测两个不同的序列。无需PCR后处理，减少分析工作量并节省材料成本。TaqMan方法的缺点：TaqMan方法的主要缺点在于需要根据不同的序列，合成不同的探针。SYBR Green I染料试剂。一般将可与双链DNA发生结合的小分子分为以下两类：嵌入剂、小沟结合物。无论哪种结合方法，用于PCR实时检测的DNA结合染料都需要满足以下两个条件：结合至双链DNA时，会有增强的荧光对 PCR 不会产生抑制我们开发更加优化的条件，使得SYBR Gre...

TaqMan qPCR：该测定不使用嵌入染料，而是使用带有 5' 荧光报告染料和 3' 淬灭染料的 TaqMan 探针。 这些探针是目标特异性的，并且在退火步骤中与引物之一下游的目标 DNA 序列结合。 当 Taq 聚合酶在延伸阶段遇到 TaqMan 探针时，它会置换并切割 5' 报告染料。 一旦报告染料与淬灭染料分离，其在每个 qPCR 循环结束时的可测量荧光信号就会显着增加。 第二条 DNA 链是平行合成的，但由于没有探针附着在它上面，因此无法通过荧光测量来监测这一过程。与 SYBR Green 检测相比，使用 TaqMan 探针的成本更高，但也具有两个显着优势：TaqMan 检测测量目标...

qPCR的实质就是PCR反应，只是在扩增产物上增加了荧光标记，通过仪器对荧光信号进行采集。荧光信号的强度与扩增得到的dsDNA的浓度成正比，因此非理想条件下的PCR荧光强度Rn=R0+YnRs＝RB+Y0(1+Ex)^nRs （Rn：第n次循环时荧光信号强度，R0：背景信号强度，Rs：每个分子的荧光强度），通过对采集荧光信号就能进行初始模板定量、基因表达量的研究。通过对PCR过程中荧光信号的实时监测，荧光强度的变化趋势，呈现出一条S型曲线即“扩增曲线（Amplication plot）”，分为四个时期：基线期、指数扩增期、线性增长期、平台期。qPCR目的PCR监测目标DNA分子扩增，PCR产物...