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来源: 发布时间:2023年06月06日

定量首先需要建立Ct值和拷贝数之间的线性关系,即标准曲线,标曲需要由标准品生成,标准品中基因序列要与待测样品中基因序列一致,从而保证引物在两者中扩增效率完全相同,标准品来源可以是质粒,纯化的PCR产物或者基因组DNA等。标准品在加样时需要注意体积比较好大于2微升,以减少标曲误差,标曲是由不同梯度标准品生成,每个标准品梯度建立Ct值与拷贝数对数值之间的联系,落在标曲上的梯度点比较好有5个及以上,至少3个点。标准品和待测样品同时反应,将待测样品检测的Ct值代入标曲后即可换算出待测样品中基因的拷贝数。荧光检测系统可接收荧光信号,每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,荧光信号累积和PCR产物形成是同步。广东Quantagene q225mxqPCR仪消毒

PCR反应需要五种关键试剂:PCR模板:也称为模板DNA,需要常规的试剂盒进行提取。如基因组DNA(gDNA),cDNA和质粒DNA。DNA聚合酶:所有PCR反应都需要可在高温下工作的DNA聚合酶。Taq聚合酶是一种常用的酶,它可以在70°C时以60个碱基/秒的速率整合核苷酸,并可以扩增高达5kb的模板,使其适用于无特殊要求的标准PCR。引物:DNA聚合酶需要短序列的核苷酸,以指示它们需要在哪里开始扩增。在PCR中,这些序列称为引物,是单链DNA的短片段(约15-30个碱基)。脱氧核苷酸三磷酸(dNTPs):是合成DNA新链的基础,包括四个基本DNA核苷酸(dATP,dCTP,dGTP和dTTP)。PCR缓冲液:PCR缓冲液可确保在整个PCR反应过程中保持比较好条件。PCR缓冲液的主要成分包括氯化镁(MGCl2,充当DNA聚合酶的辅助因子),tris-HCl和氯化钾(在反应过程中保持稳定的pH值)。目前市面上已经有很多成熟的包含PCR缓冲液的Taq聚合酶。湛江荧光定量qPCR仪采购QPCR用于基因表达研究、转基因研究,药物疗效考核、病原体检测等诸多领域。

TaqMan 方法的优点:需要在探针和目标分子(靶点)之间发生特异性的水解(杂交),方可生成荧光信号。可使用明显不同的报告基因染料标记探针,在一个反应管内扩增并检测两个不同的序列。无需PCR后处理,减少分析工作量并节省材料成本。TaqMan方法的缺点:TaqMan方法的主要缺点在于需要根据不同的序列,合成不同的探针。SYBR Green I染料试剂。一般将可与双链DNA发生结合的小分子分为以下两类:嵌入剂、小沟结合物。无论哪种结合方法,用于PCR实时检测的DNA结合染料都需要满足以下两个条件:结合至双链DNA时,会有增强的荧光对 PCR 不会产生抑制我们开发更加优化的条件,使得SYBR Green I染料的使用不会对PCR产生抑制并带来相对于溴化乙锭更为灵敏的检测。

合成引物时需注意:在设计PCR引物时,首先确定要扩增的DNA区域,并设计一对专门位于目标区域的引物,一个在正向链上,另一个在反向链上。引物须具有特异性,避免扩增出非特异性片段。正向引物与反向引物应具有相似的退火温度,GC含量与退火温度相关,调整引物长度可以改变退火温度。避免引物序列有二级结构或引物二聚体,会降低PCR效率。许多的在线工具可用于辅助引物设计。PCR扩增包括三组被设定好的时间和温度,步骤为:变性,退火和延伸1、变性:PCR的第一步称为变性,将模板DNA加热到95°C几秒钟,将两条DNA链分开,使它们之间的氢键迅速断裂。2、退火:反应混合物冷却30秒至1分钟。退火温度通常为50-65°C,但确切的比较好温度取决于引物的长度和顺序。不同的引物可能具有不同的退火温度。3、延伸:温度升至混合物中存在的DNA聚合酶的理想工作温度,通常约为72°C。DNA聚合酶附着在每个引物的一端,并合成与模板DNA互补的DNA新链。Quantagene q225系列qPCR 43分钟完成实验,加3分钟做完熔解曲线只需43分钟即可完成40循环的常规qpcr实验。

PCR方法:PCR的原理在这里不需要进一步解释。多年来,研究人员基于此开发了一系列衍生技术。当前的PCR方法可分为三类:终点PCR,qPCR和dPCR。终点PCR:端点PCR是原始,简单的PCR方法,并且仍然被使用。PCR反应完成后,用户只能通过凝胶电泳,毛细管电泳等方法检测产物。终点PCR本身无法量化,因为反应产生的DNA数量可能无法反映初始情况。例如,不同样品和序列之间的扩增效率存在差异。DPCR通常更准确。 qPCR可以轻松区分两倍的浓度差异(例如5个拷贝和10个拷贝),但是面对小的差异,它却较弱。 dPCR理论上可以识别相差少于20%的拷贝数,例如5和6拷贝。该准确度对于量化涉及染色体重排的基因的拷贝数或量化患者血液中的循环生物学指标特别有用。由于dPCR相当于在反应结束时稀释样品并读取数据,因此dPCR比qPCR对抑制剂的抵抗力更高。在进行大量SNP标记分型时无需合成荧光探针和荧光引物。可以的节省实验成本。广东Quantagene q225mxqPCR仪作用

为了进一步确保荧光检测的就是靶DNA序列,人们又设计了只能与目的DNA序列特异结合的荧光探针如TaqMan探针。广东Quantagene q225mxqPCR仪消毒

PCR 反应中通过控制温度变化使得核酸分子重复地解链与延伸,从而实现对目的片段的指数扩增。因此,准确的温度控制与快速的变温系统是实现高效的 qPCR 实验的基础与关键。加热块各处温度越一致,则因位置差异。而带来的样品之间的扩增效率差异越小。q225 系列荧光定量 PCR 仪突破性地采用了复合式液体冷却循环系统,极大的消除了单一风冷散热器所带来的温度均一性差、降温速率慢、仪器噪音大等缺陷,可将96 孔间温度差控制在±0.15°C 以内,确保每一孔内的实验均严格按照您所设置的控温程序进行。qPCR 反应所需时间很大程度上取决于对反应溶液进行变温所需要的时间,而这一过程又受到加热块升降温速度和液体升降温速度两方面的影响。q225 所使用的热循环系统峰值变温速率可达4°C/s,更重要的是,经过精密设计的加热块能够很大程度地贴合孔板形状,实现高效的热传导,使得在加热块达到预定温度后反应溶液也能在短时间内达到相同温度,反应溶液温度更为均一。q225 出色的热循环系统设计使得40 个循环的常规 qPCR 可以在短短43 分钟内轻松完成,让您的工作效率获得质的提升 。广东Quantagene q225mxqPCR仪消毒

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