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广东荧光定量qPCR仪应用

来源: 发布时间:2023年06月12日

qPCR和dPCR:研究人员已经通过两种方式克服了定量PCR分析的挑战:实时定量PCR(qPCR)和数字PCR(dPCR)。qPCR主要使用插入染料或荧光探针(例如TaqMan)。通过监测PCR期间的荧光强度,可以比较多个样品的DNA水平。数字PCR(dPCR)的基本工作原理很简单。先将样品分为多个PCR反应,每个反应多包含一个模板。然后通过对阳性和阴性反应进行计数来确定初始样品中模板分子的数量。尽管qPCR和dPCR都能够定量样品中的核酸,但它们有一个重要的区别。qPCR只能实现相对定量(例如,样品A的目标序列是样品B的目标序列的两倍),除非使用此标准生成标准曲线。数字PCR本身是定量的,不需要标准曲线。另一方面,qPCR技术更加成熟和众所周知,市场上有大量商业产品可供选择。dPCR仍然是小的新鲜肉。它不如qPCR使用且价格昂贵。与dPCR相比,qPCR更适合于高通量分析,并且动态范围广。q225 出色的热循环系统设计使得40 个循环的常规 qPCR 可以在短短43 分钟内轻松完成,让您的工作效率获得质提升 。广东荧光定量qPCR仪应用

TaqMan试剂:一开始,使用的是嵌入式染料进行的实时荧光PCR (qPCR) 产物定量。但是这些染料存在了重大缺点,即使会同时去检测特异性以及非特异性PCR产物的扩增量。TaqMan方法的开发通过去引入基于Taq DNA聚合酶5’核酸酶活性的荧光标记探针,实时定量PCR系统得到了的提升。这些荧光探针的使用,使得实时定量的方法得到了发展,实现了对特定扩增产物的检测。此外,荧光标记探针的开发,也免去了用于探针降解分析的PCR反应后处理的过程。广东荧光定量qPCR仪应用非理想条件下的PCR反应:PCR产物量Yn=Y0(1+Ex)^n。

相对定量实验方法包括两种重要方法:ΔΔCT Method:使用内参基因定量所研究样品和参照样品的目的基因。内参基因与目的基因可以同时反应,也可以单独反应;双标准曲线法:对每个样品的内参基因和目的基因都做定量,求出每个样品中内参基因和目的基因的数量,然后根据相对定量的基本公式来求出目的基因的差异表达。定量需要由标准曲线建立Ct值跟拷贝数之间的关系,标准曲线由标准品生成,标准品可以是已知浓度的RNA、质粒或合成的寡核苷酸链生成,定量未知模板时标准样品和未知样品必须同时反应。

SYBR Green I染料法实时定量PCR反应在带透明盖的塑料小管中进行,激发光可以直接透过管盖,激发荧光探针。荧光探针事先混合在PCR反应液中,只有与DNA结合后,才能够被激发出荧光。随着新合成目的DN段的增加,结合到DNA上的荧光探针增加,被激发产生的荧光也相应增加。简单的DNA结合的荧光探针是非序列特异性的,以非饱和染料中常用的SYBR GreenI染料为例,这种荧光染料激发光波长520 nm,只能与双链DNA结合,与DNA双链结合时,荧光强度出现明显增大的非特异性染料。每形成一条DNA双链,就有相应数量的SYBR Green I染料嵌入并产生荧光,因此荧光信号强度变化与PCR产物浓度变化呈正相关,原理如图2所示。耀海在进行质粒拷贝数测定时采用qPCR染料法,即大肠杆菌克隆表达得到的质粒DNA,其菌种质粒拷贝数的测定采用荧光定量PCR法。以质粒中卡那霉素抗性基因序列为靶标基因设计扩增引物,建立基于SYBR的qPCR检测方法,用于某大肠杆菌菌种中质粒拷贝数的检测。qPCR荧光标记法分为SYBR Green I染料法为主的荧光染料嵌合法,以Taqman探针法为主的荧光探针法.

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