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来源: 发布时间:2023年06月09日

PCR反应需要五种关键试剂:PCR模板:也称为模板DNA,需要常规的试剂盒进行提取。如基因组DNA(gDNA),cDNA和质粒DNA。DNA聚合酶:所有PCR反应都需要可在高温下工作的DNA聚合酶。Taq聚合酶是一种常用的酶,它可以在70°C时以60个碱基/秒的速率整合核苷酸,并可以扩增高达5kb的模板,使其适用于无特殊要求的标准PCR。引物:DNA聚合酶需要短序列的核苷酸,以指示它们需要在哪里开始扩增。在PCR中,这些序列称为引物,是单链DNA的短片段(约15-30个碱基)。脱氧核苷酸三磷酸(dNTPs):是合成DNA新链的基础,包括四个基本DNA核苷酸(dATP,dCTP,dGTP和dTTP)。PCR缓冲液:PCR缓冲液可确保在整个PCR反应过程中保持比较好条件。PCR缓冲液的主要成分包括氯化镁(MGCl2,充当DNA聚合酶的辅助因子),tris-HCl和氯化钾(在反应过程中保持稳定的pH值)。目前市面上已经有很多成熟的包含PCR缓冲液的Taq聚合酶。准确的温度控制与快速的变温系统是实现高效的 qPCR 实验的基础与关键。苏州厂家qPCR仪价格

阴性对照一般是指用水代替模板的反应孔,体系中除了模板,包括了其他的反应组分。由于qPCR的高灵敏性,阴性对照有出现扩增信号的情况,那么在针对这类问题时,我们需要判断其原因所在。使用染料法进行qPCR实验时,首先查看阴性对照的溶解曲线主峰是否跟阳性孔的主峰位置一致。如果一致,要看两者Cq相差多少,比如,针对某一种引物的实验样品Cq值为28. 5,阴性对照的Cq值为33. 6,由于Cq值相差大于5,如果按95%的扩增效率计算,两者模板量相差28倍之多,对分析数据影响不大,所以实验样品的Cq值还是可以采用的;但是,如果两者的Cq值相差 1~2,这说明阴性对照中有较大的模板污染,则需要考虑更换试剂或引物,分区加样,重新实验。如果不一致,阴性对照主峰对应的Tm值小于阳性孔的Tm值,则可能是引物性能不好,无模板或使用低浓度模板下会出现引物二聚体,这种情况则需要考虑更换引物,保证引物特异性以及扩增效率。上海高效qPCR仪供应商qpcr在扩增每个循环中模板DNA通过变性、复性、延伸三个阶段形成更多的子代DNA,为下一个循环提供模板DNA。

双杂交探针是两个特异性探针,一个只5’端标记荧光基团,另一个只3’端标记猝灭基团。这两个探针序列和模板特异性结合,结合的位置非常邻近。在qPCR反应的退火阶段,当两个探针与模板结合时,位于两个探针头尾的荧光基团之间产生FRET现象,促进受体的荧光基团释放一种波长的荧光信号,从而达到实时监控反应进程的目的。Amplifluor系统包括两个特异性引物和一条检测探针(UniPrimer),其中一条引物的5’末端带有部分序列和UniPrimer的3’末端部分序列相同。UniPrimer两端分别被荧光和淬灭基团标记且有发卡结构。反应时,UniPrimer结合到特异性引物扩增出的模板上作为引物进行PCR反应,在延伸的过程中UniPrimer发夹结构打开,荧光信号释放。蝎形引物为茎环结构,其5’端带有一个荧光基团FAM,3’端带有一个淬灭基团DABCYL,其环的部分序列和模板完全互补配对。体系有模板时,茎环结构稳定,荧光和淬灭基团相距近,不能检出荧光信号;体系无模板时,蝎形引物和模板特异性结合并起始PCR扩增,蝎形引物的环结构与扩增出的模板互补杂交,导致茎环结构被破坏,释放出大量的荧光信号,荧光仪器可以实时收集这些荧光信号并生成相应的荧光扩增曲线。

使用 PCR 扩增 DNA 是当今实验室的一项基础技术,创新不断将其应用范围从研究实验室扩展到临床。定量 PCR (qPCR) 允许对靶 DNA 进行相对定量,并且是一种可靠的、已建立的测试特定序列是否存在的方法(例如,大多数基于 PCR 的冠状病毒测试使用 qPCR)。另一种 PCR 形式,数字PCR (dPCR) 或液滴数字 PCR (ddPCR),使用类似的化学方法检测 DNA 序列,但在许多微小体积或液滴中进行检测,利用数学的力量提高信噪比。qPCR和 dPCR 有很多相似之处和不同之处,但在与 PCR **交谈时,有几个重要的品质更加突出。尽管 dPCR 可能在灵敏度方面表现出色,但 qPCR 仍然是许多其他应用的比较好选择。“我们建议我们的客户在基因表达中使用 qPCR,因为它的动态范围很广;其量化不同表达水平、区分剪接变体和多重分析的能力;及其高通量应用和自动化的能力,”Alsarraj 说。事实上,它在实验室和监管环境中更为人所知,并用于基因、健康状况或传染病的筛查。qPCR面对小的差异较弱,dPCR则可识别差异较小的拷贝数。

定量方法包括相对定量和定量,两者的重要差异在于相对定量的结果是差异性的结果,涉及比较;而定量的结果是一个具体数值,对于基因表达量而言是基因的拷贝数,不涉及任何比较。相对定量首先需要确定一个内参基因,内参基因作用有检测样本材料中RNA是否降解、纠正样本加样的差异、校正cDNA合成速率差异及校正PCR抑制剂的影响,其本质作用是利用内参基因的Ct值对目的基因的Ct值进行均一化处理,常用的内参基因包括DH、β-actin、18S rRNA,使用的时候需要注意其序列必须是物种本身的特异序列,虽然其比较保守,但不同物种也会存在碱基差别。另外,相对定量需要确定参照物,因为涉及比较,参照物选择不同,所得的定量结果可能完全相反,经常选择的参照物一般是对照组或未处理组。使用 PCR 扩增 DNA 是当今实验室的一项基础技术,创新不断将其应用范围从研究实验室扩展到临床。上海高效qPCR仪供应商

定量 PCR (qPCR) 允许对靶 DNA 进行相对定量,并且是一种可靠的、已建立的测试特定序列是否存在的方法。苏州厂家qPCR仪价格

免疫沉淀——捕获并分离蛋白质-DNA复合物使用抗体捕获蛋白质-DNA复合物中的目标蛋白质是实验成功的关键因素。抗体免疫沉淀并从细胞核组分中分离蛋白质,去除不相关的细胞物质。使用抗体结合磁珠完成所得抗体-蛋白质-DNA复合物的纯化。经过孵育后,充分洗涤磁珠-抗体-蛋白质-DNA复合物,纯化并洗脱蛋白质-DNA复合物。制备DNA——解交联和DNA纯化:现在含有目标蛋白质的染色质片段已分离,需要解交联并纯化DNA。解交联通常采用高热孵育和/或消化来完成。注意:此时可以停止ChIP。经过解交联和/或DNA纯化后,可以将样品于-20°C储存。苏州厂家qPCR仪价格

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