过去 5 年里,单细胞测序技术的快速发展极大地加速了生物医学领域的相关研究,让科研人员以更广的维度来研究生命的本质。随着 2013 年单细胞测序技术被 Nature Methods 杂志评选为年度技术...
单细胞RNA-seq能够**地提供每个细胞的RNA表达谱,并鉴定异质细胞群中的稀有细胞。尽管**异质性可归因于累积突变,但即使是遗传上相同的细胞在相同环境下也可能表现出基因和蛋白表达水平的差异,从而导...
细胞是生命活动的基本功能单位。不同类型细胞之间的相互作用网络构成了生命的基础。研究对象的这一“基本属性”决定了单细胞高通量技术是目前我们解析各种生命现象、揭示各种生物学机制的**强有力的技术手段。...
单细胞测序并非**对一个细胞进行测序,而是对单一细胞的转录组进行捕获和检测,可以理解为单细胞水平上的测序,能同时测序成千上万个细胞。单细胞测序技术的出现和应用,能够完全反映组织里不同细胞群体的异质性信...
欧易生物单细胞测序近期高分文章不断,在接下来的几篇单细胞文献解读软文里,我们将为大家持续送上近期合作发表的单细胞文献解读。,5月5日由山东第一医科大学附属青岛眼科医院周庆军和史伟云教授团队在Ocula...
10x Genomics空间转录组技术的准确性高吗?下图是一个将10x Genomics空间转录组技术应用于小鼠海马体研究的案例。A图为脑组织切片的HE染色结果,从10x Genomics空间转录组分...
空间转录组技术包含两种芯片,分别为组织优化芯片(Tissue Optimization)和基因表达芯片(Library Preparation)。组织优化芯片用来摸索组织透化的比较好时间,基因表达芯片...
1. 10x Genomics空间转录组用于文库构建的每张载玻片上有四个捕获区域,每个捕获区域的大小为6.5x6.5mm,包含5000个被条形码标记的点(barcoded spots),每个点的直径...
尽管前传时代的空间技术被迅速弃用,但其思想和方法是当今时代空间转录组学发展的基础。在过去的 5 年中,随着众多新技术的出现和 10x 公司 Visium 技术解决方案的商业化普及,该领域得到了快速的发...
高通量空间转录组学数据的处理和分析需要新颖的方法和工具支撑,尤其是在预处理、scRNA-seq 数据的空间重构、基于微阵列数据的细胞类型去卷积、空间高变基因的识别、细胞间相互作用的推导等。scRNA-...
空间转录组技术原理是什么?当组织冷冻切片附在空间转录组载片上时,条形码引物结合并从组织中捕获邻近的mRNA。被捕获的mRNA开始逆转录,得到的cDNA中包含了空间条形码。分析Illumina测序结果中...
10xVisium空间转录组技术原理为将新鲜冷冻的组织切片,置于文库制备载玻片上,经过固定、染色和透化后,释放出mRNA,mRNA与空间条形码捕获探针相结合,从而捕获基因表达信息。然后将捕获的mRNA...
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