您好,欢迎访问

商机详情 -

贵州空间转录组有什么用

来源: 发布时间:2021年12月07日

10xVisium空间转录组技术原理为将新鲜冷冻的组织切片,置于文库制备载玻片上,经过固定、染色和透化后,释放出mRNA,mRNA与空间条形码捕获探针相结合,从而捕获基因表达信息。然后将捕获的mRNA合成cDNA并制备测序文库进行测序,并对数据进行可视化分析。空间转录组技术作为当今**前沿的科研技术,相信很多老师都希望将其运用于自己的课题中,快速发表高分文章。欧易生物具有上百例空间转录组项目执行经验,致力通过质量的服务,助力各位科研工作者取得新的突破。Science发表了将组织扩展和原位RNA测序结合起来的新型空间转录组技术ExSeq。贵州空间转录组有什么用

空间转录组是在组织原位检测基因表达的一种技术,与bulk RNA-seq或单细胞转录组测序相比,空间转录组避免了组织中细胞位置信息的丢失,使得我们在检测基因表达的同时获得基因在组织内部的空间位置信息。已发表的关于空间转录组技术有Slide-seq , LCM-seq , seqFISH, MERFISH , Liver single cell zonation , Geo-seq and Tomo-seq。这些方法或是在细胞数量上限制较大,或是存在有效测序深度不足等问题。正是由于空间转录组可以从多维度解析生物学过程的特点,近年来关于空间转录组无论是在技术开发,还是大规模应用或商业化,都得到蓬勃发展。


河北技术空间转录组空间转录组样本的组织切片的细胞中会释放出mRNA,迁移到每个spot的mRNA会被标记上相应的barcode序列。

单细胞转录组测序技术的如火如荼,伴随着空间转录组测序技术的蓬勃发展,可以看到,在现有的高通量检测技术领域,这两种技术已为科学研究的发展提供了前所未有的技术支撑。从2019年单细胞多组学被评为《Nature Methods》年度技术进展,到2020年空间转录组技术也被评为年度技术进展,相信在接下来的时间里,单细胞转录组和空间转录组将为生命科学的发展做出极其重要的贡献。单细胞转录组测序技术的特点在于提供详实的每个细胞的转录表达信息,但是缺失了来源组织的空间组成信息。现有商用空间转录组测序技术的特点在于提供了完整的组织空间位置信息,但是每个捕获spot的信息无法达到单细胞分辨率(10个左右细胞)。因此,这两个技术的存在是天然互补的,而将两者的结合也是水到渠成,完美结合。

一些实现空间转录组学的重要技术,**早可以追溯到二十世纪七十年代,长期以来,各种形式的原位杂交技术(ISH)已用于可视化空间中的基因表达。从技术原理中不难看出,空间转录组技术**为特殊的载玻片。ISS 方法通常通过基于连接(SBL)或者基于合成(SBS) 的原位测序, 确定靶向基因序列或非靶向的 cDNA 短片段,**终获得空间转录组信息。根据测序链接策略的不同(SOLiD,cPAL和SEDAL),基于 SBL 的原位测序技术方法的代表性技术分别为 FISSEQ,ISS,STARmap。空间转录组是一项前沿技术,涉及到很多细节方面的准备工作。

空间转录组研究的的必要性。研究单细胞我们想要探究细胞间的异质性,但是常规的单细胞是将细胞解离成单细胞悬液,然后利用单细胞分离技术(微孔,微板,液滴)等方法实现单细胞建库,这里比较大的问题是是细胞失去了原本在组织的空间信息。然而这个空间信息在实际研究中有很重要。特别是在研究细胞命运机制及细胞谱系发生空间位置的信息显得尤为重要,因此发展空间转录组技术实现细胞的位置信息的保留,对研究此类细胞状态尤为必要。空间转录组的条形码逆转录oligo(dT)引物在显微镜载玻片表面的有序附着。北京欧易生物空间转录组质量

scRNA-seq 技术的进步启发了利用高分辨率转录组定量分析与空间转录组学数据的互补性质的新方法。贵州空间转录组有什么用

 空间转录组学(ST)是一种方法,允许在组织样本中可视化和定量分析转录组与空间分辨率。通过在载玻片上排列含有位置条形码的寡核苷酸的组织切片,该方法声称可以生成具有精确位置信息的高质量的RNA-seq cDNA文库。条形码芯片有1007个带有独特条形码序列的引物位点。每个位置都有一个直径100µm(对应于一个组织域)中心到中心的距离是200µm。欧易生物具有上百例空间转录组项目执行经验,在空间转录组样本处理、实验和数据挖掘上的成功经验,致力通过质量的服务,助力各位科研工作者取得新的突破。贵州空间转录组有什么用

上海欧易生物医学科技有限公司主要经营范围是医药健康,拥有一支专业技术团队和良好的市场口碑。公司业务涵盖科研服务,科研检测,学术研究,技术咨询等,价格合理,品质有保证。公司秉持诚信为本的经营理念,在医药健康深耕多年,以技术为先导,以自主产品为重点,发挥人才优势,打造医药健康良好品牌。在社会各界的鼎力支持下,持续创新,不断铸造***服务体验,为客户成功提供坚实有力的支持。

扩展资料

空间转录组热门关键词

空间转录组企业商机

空间转录组行业新闻

推荐商机