随着美国临床蛋白质组**分析项目（CPTAC）和中国人类蛋白质组计划(CNHPP)等大型蛋白质组学研究计划的推进，发表了一系列**的大规模人群多组学分析文章[2,3]。这些高分文章通过基因组学、转录组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、代谢组学、微生物组学等技术，在上百例的病例样本中***表征了某种**的分子特征。对比这些文章，可以发现蛋白质组学数据在多组学数据分析中逐渐成为**结果，且蛋白质组学数据分析有些共同特点，即：1）基于蛋白质组进行**分子分型2）分析不同亚型患者的临床特征3）免疫、代谢、突变、微生物等**领域研究热点在不同亚型中的差别分析4）筛选亚型特征分子作为预后标志物或潜在的药靶进行验证或机制研究该文是樊嘉院士/周虎研究员/高大明研究员/**教授团队继2019年Cell发表的肝细胞*多组学研究后，同样基于蛋白质组为**的多组学联合分析策略，进一步阐释了蛋白质组学驱动精细医学的优势，为**的发***展机制、分子分型、预后监测和个性化***策略提供新思路。随着蛋白质组学技术的发展，蛋白质组学数据分析的方法也将同样快速发展。辽宁蛋白组学tmt报告解读
通过蛋白质组学质谱鉴定、PRM靶向鉴定、iTRAQ标记定量蛋白组学等研究方法，发现了N-豆蔻酰化在肝脏**发生中发挥重要作用，揭示了NMT1的N-豆蔻酰化抑制抗**发生的NDP，并通过干扰泛素化来刺激促**发生的NUP机制。为靶向N-豆蔻酰化和NMT1可能有助于***肝*提供了理论依据。中文标题：NMT1依赖于POTEE发生N-豆蔻酰化并通过差异调节靶标的泛素化来刺激肝脏**的发生研究对象：细胞、小鼠、人**组织发表期刊：FrontiersinOncology影响因子：6.244发表时间：2021年5月合作单位：上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心运用生物技术：iTRAQ标记定量蛋白组学、PRM靶向验证、质谱鉴定、qRT-PCR、IHC、WB、IP文章中iTRAQ标记定量蛋白组学由欧易/鹿明生物提供技术支持广东串联质谱蛋白组学一站式服务,研究不同生物体在不同时刻/状态下蛋白质表达的变化。
作者进行了综合分析，将蛋白组学和代谢组学中的***生物标志物合并到通路分析中，并确定了半乳糖代谢、戊糖和葡萄糖醛酸盐相互转化、柠檬酸盐循环和**酸代谢这几种途径。然后结合蛋白质和代谢标志物来预测DKD状态。五种机器学习模型表明，组合模型提高了DKD预测的准确性和稳定性。图中展示了RF的结果。总的来说，组合多组学标志物模型是一种强有力的提高DKD诊断的方法。1.蛋白组学结果表明，α2-巨球蛋白、组织蛋白酶D和CD324可作为检测DKD进展的潜在生物标志物。2.代谢组学结果表明，半乳糖代谢和甘油脂代谢是DKD的主要代谢途径，此外甘油-3-半乳糖苷可作为预测DKD的**标志物。3.蛋白组学和代谢组学的组合可以提高预测和诊断DKD的准确性和稳定性。血清综合组学的生物标志物可用于DKD的预警和诊断。该研究为优化DKD的管理提供了数据资源。
蛋白组学研究实用案例：东南大学医学院院长刘必成教授领导的肾脏病研究所在Science advances期刊发表了题为“Extracellular vesicle–encapsulated IL-10 as novel nanotherapeutics against ischemic AKI"的研究成果，通过蛋白组学+多层组学研究方法，建立IL-10细胞囊泡高表达模型的构建，提出并验证了IL-10细胞外囊泡的靶向缺血性肾损伤的假说，探究了IL-10细胞外囊泡作为新型纳米药物的机理。中文标题：细胞外囊泡包裹的IL-10作为抗缺血性急性肾损伤的新型纳米疗法研究方向：新药研发及其机制研究发表期刊：Scienceadvances影响因子：14.136发表单位：中国南京东南大学附属中大医院肾内科运用生物技术：LC-MS/MS蛋白组学（由鹿明生物提供技术支持）蛋白质组学的特点蛋白质组和蛋白质组学的概念。
蛋白质组学(由鹿明生物提供技术支持)；2021年8月，中国医学科学院基础医学研究所赵春华和韩钦课题组在Aging and disease期刊发表了题为“MSC-derived Exosomes can Enhance the Angiogenesis of Human Brain MECs and show Therapeutic Potential in a Mouse Model of Parkinson's Disease”的研究成果，通过蛋白质组学研究方法，发现了间充质干细胞衍生的外泌体可以通过增加ICAM1的表达来促人脑MECs血管生成，并减轻MPP+对细胞的损伤，***间充质干细胞衍生外泌体***帕金森的可能性。单细胞组学 单细胞蛋白组学 蛋白质组学 。福建蛋白组学和基因组学的差异
蛋白组学蛋白质组学-一站式解决蛋白质组学难题。辽宁蛋白组学tmt报告解读
iTRAQ标记定量蛋白组学研究方法：2021年4月，南京林业大学喻方圆教授（一作：吴岐奎）课题组在JournaloftheScienceofFoodandAgriculture期刊发表了题为“ProteomicanalysisofmetabolicmechanismsassociatedwithfattyacidbiosynthesisduringStyraxtonkinensiskerneldevelopment”的研究成果，通过转录组学+iTRAQ标记定量蛋白组学研究方法，分析东京野茉莉种子发育过程中脂肪酸生物合成相关基因的表达趋势，确定油脂积累的主要影响因子并构建其调控网络。为野茉莉属植物种子油用研究和后续功能分析研究提供了一定的研究基础。辽宁蛋白组学tmt报告解读
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