环境中的六氯环己烷可以通过食物链而发生生物富集作用，从日本对水稻的农药含量调查发生，水稻与一般水生植物有着共同性质，都具有富集作用。在稻草中六氯环己烷的残留量较高，约有其种植土壤含量的4-6倍，豆类对γ-六氯环己烷的吸收率特别高，其含量为土壤残留量的数十倍之多。六氯环己烷在环境和生态系中的污染已远及南极的企鹅、北极格陵兰的冰块和2000米以上高山顶的积雪。调查表明，六氯环己烷主要蓄积在人体脂肪内，存留较久的是β-六氯环己烷，它的蓄积作用较强。例如：在口服后可持续排泄6个月，而γ-六氯环己烷在1至2周内即可排尽。与普通试剂相比，砌块可以显著提高合成效率。长宁区高纯度脂肪族类分子砌块机理
药物设计中引入螺环后，尽管药效会适度增加或降低，但是选择性会显著提高。Reilly等人研究了多巴胺D3受体拮抗剂中不同螺环骨架对哌嗪主要的替代。研究发现尽管有些片段具有螺环骨架，其活性却比哌嗪类似物降低了100多倍，但与相关的多巴胺D2受体作用相比，其选择性增加了10倍。在进一步优化的过程中，通过对一组特定的胺受体的结合亲和力的测量，发现螺环骨架与哌嗪核选择性比为905倍，说明螺环化合物的选择性更好。各种稳健的合成方法在学术界的发展，以及合成砌块的商业可用性，将加速立体化学复杂螺环在药物发现中的应用。金山区实验用脂肪族类分子砌块放大生产环己烷制备工艺主要是纯苯加氢法。
含硼的螺环化合物也具有潜在医疗用途，硼的优势作用是它的空p轨道，它可以共价结合目标蛋白，例如与目标蛋白的丝氨酸或苏氨酸残基结合。Natsutani等人合成了含硼的螺环骨架，对其在人肝微粒体(HLMs)中的亲脂性和代谢稳定性进行了评价。研究表明该螺环化合物的logP值低于4,具有良好的稳定性。螺环化合物的构型会极大地影响亲和作用从而影响药物性质。Zhou等开发了一种新的登革病毒(DENV)抑制剂，在登革病毒高通量表型筛选中发现了目标螺环化合物的外消旋体，其对DENV表现出活性。这种含有螺旋吡唑吡啶酮骨架的抑制剂可以通过非结构蛋白4B（NS4B）抑制DENV的复制。通过手性高效液相色谱法对映体进行分离后发现，(R)-构型抑制剂的体外活性是(S)-对映体的225倍。
环己烷用作溶解纤维素醚、漆、树脂、脂肪、蜡、油、沥青和生橡胶的溶剂。环己烷还用于香水制造、表面涂层操作（漆）、合成己二酸以生产尼龙 66 和工程塑料、合成尼龙 6 中的己内酰胺、油漆和清漆去除剂、提取精油、 在用于测定分子量的分析化学中，在己二酸、苯、环己基氯、硝基环己烷、环己醇和环己酮的制造中，在营地炉灶的固体燃料的制造中，在杀菌剂配方中（具有轻微的杀菌作用）在工业重结晶中 类固醇、有机合成、重结晶介质玻璃替代品、固体燃料、分析化学和粘合剂制造。环形化合物根据碳环内是否含有非碳原子（如：O、N、S、P等）分为碳环化合物和杂环化合物。
桥环烷烃的环数是这样确定的：将环上的键切断，根据使其变成链状化合物所需切断的键的较小次数即为该桥环化合物所含的环数。确定主环、主桥和次桥:将碳原子数较多的环确定为主环,主环以外的碳链均为桥，较长的桥为主桥,其他的桥为次桥。若较长的桥有两个或多个,要选较对称地分割主环的桥为主桥。桥环化合物内外型判断方法：内型化合物即非主桥的桥上的取代基与主桥在异侧的化合物，外型化合物即取代基与主桥在同侧的化合物。含有桥式二环体系的脂环族化合物的特点是在它们的环中有三个或者更多的共用碳原子。环烷烃的氧化，环烷烃与烷烃相似。虹口区自主研发脂肪族类分子砌块科研应用
己烷是常用的非极性具汽油味的有机溶剂，被普遍应用于色谱法中。长宁区高纯度脂肪族类分子砌块机理
六氯环己烷在植物、昆虫、微生物及动物体内可代谢生成多种产物，这些都作为硫和葡萄糖醛酸的共轭物而被排泄。在所有情况下，六氯环己烷代谢的起初产物都是五氯环乙烯，它以几种异体的形式被分离出来。在温血动物体内生成的酚类以酸式硫酸盐或葡萄糖苷酸的形式随尿及粪便排出体外。在微生物影响下也能生成酚类，但它们在土壤中还要进一步分解而使分子整个被破坏。在动物(大鼠)体内，可生成二氯、三氯和四氯苯酚等各种异构体。在昆虫体内，六氯环己烷及五氯环己烯首先与氨基酸的硫氢基发生反应，生成环己烷系、环己烯系和芳香系的衍生物，苯硫酚和它们的衍生物是这些反应的终产物。长宁区高纯度脂肪族类分子砌块机理
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