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江苏植物冷冻切片与空间代谢组学

来源: 发布时间:2023年03月31日

质谱成像(Mass Spectrometry Imaging, MSI)作为一种新型的分子影像技术,能够直接从生物组织中获得大量已知或未知的内源性代谢物和外源***物等分子的结构、含量和空间分布信息。相对于其他成像方法(如荧光成像、放射性标记成像等),该技术无需化学或放射性标记、不需复杂样品前处理,具有高特异性、高通量和空间信息保留的突出优势。质谱成像技术可以实现生物组织中上千代谢物的定性、定量和定位分析,结合生物信息学分析,发展为空间代谢组学方法,可从生物组织原位发现差异代谢物,并识别其生物学功能。本篇小鹿盘点5篇空间代谢组学在科学研究中的经典应用~给您的组学研究提供更多支持~空间代谢组学的力量探究前列腺*。江苏植物冷冻切片与空间代谢组学

空间代谢组学:质谱成像方法提供了一种直接获取代谢网络信息的途径,以系统地深入了解大脑的代谢活动。基于KEGG数据库的Metaboanalyst软件进行代谢网络分析。共找到20条KEGG代谢通路,包含126个具有微区信息的代谢物,图2显示了涉及丙氨酸-天冬氨酸和谷氨酸代谢、花生四烯酸代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、肌酸途径、GABA能突触、葡萄糖代谢、谷胱甘肽代谢、甘油磷脂代谢、甘氨酸-丝氨酸和苏氨酸的代谢、组氨酸代谢、赖氨酸代谢、苯丙氨酸代谢、多胺代谢途径、嘌呤代谢、嘧啶代谢和TCA循环、色氨酸代谢、酪氨酸代谢、缬氨酸-亮氨酸和异亮氨酸代谢和类固醇***合成途径。上海植物冷冻切片与空间代谢组学空间代谢组通过质谱成像技术。

空间代谢组学:在大鼠脑绘制特定区域分布的极性代谢物图谱使用AFADESI-MSI在正离子和负离子模式下分别获得298个和372个微区轮廓清晰的代谢物离子图像。使用精确分子量并结合同位素丰度,通过人类代谢组数据库(HMDB)对离子图像进行识别,鉴定出多种内源极性代谢物,包括氨基酸、核苷酸或核苷、碳水化合物、脂肪酸和神经递质等。***系统(CNS)的特定功能和特定解剖区域相关。例如,乙酰胆碱在大脑皮层中高度表达;γ-氨基丁酸是一种抑制性神经递质,其在大脑皮层的信号强度较低,在中脑、嗅球和下丘脑中的浓度较高。

AFADESI空间代谢组技术:免标记、无需基质喷涂、周期短、定位准是AFADESI空间代谢组技术的主要特点。该技术作为一种新型的分子影像技术,能够获得组织***中1000Da以下代谢物和药物的定性、定量、定位三个维度的信息。在获得AFADESI平台原创团队全力支持下,经过2021年一整年的研发及项目运营落地,鹿明生物积赞了如下优势。一、专家支持AFADESI-MSI原创团队**专家-贺玖明教授(中国医学科学院北京协和医学院药物研究所PI)全力支持,参与的基于AFADESI平台发表的方法学及应用文章篇已在Gut、PNAS、Theranostics、AdvancedScience、Analyticalchemistry、AnalyticaChimicaActa等期刊上发表10+篇。空间代谢组三个维度的分析。

作者进行了空间代谢组学(∼50μm的空间分辨率),并根据m/z848.63和m/z844.52对主要的髓鞘标志物进行了成像,推测它们分别属于Cer(D18:1/24:1)和PC(38:6)(图2G)。白质和灰质的代表性质谱如图2H所示。结果表明,使用拉曼光谱结构信息和空间代谢组学对髓鞘中的脂质进行特定的成分分析是可能的。对单个有髓组织成分光谱的分析证实,构成有髓组织光谱的主要分子是脂质,包括脑苷脂、胆固醇、鞘磷脂、磷脂酰胆碱,以及程度较小的蛋白质(图2F)。空间代谢组学,代谢组数据库。云南质谱成像与空间代谢组学

一文读懂空间代谢组学:DESI-IMS与MALDI-IMS的区别。江苏植物冷冻切片与空间代谢组学

分子成像技术是研究大脑中DNA、RNA、蛋白质和代谢产物的强大工具。质谱成像技术(MSI)是一种检测大脑中蛋白质、代谢物和脂质物质的高灵敏度和高通量分子成像技术,在**边缘诊断、**生物标志物发现、药物分布和机理阐述等领域有***的应用。本文作者开发了一种基于敞开式空气动力辅助解吸电喷雾离子化质谱成像(AFADESI-MSI)技术的代谢网络映射方法,对大鼠脑不同极性的小分子代谢物(m/z50-500Da)进行微区分布研究,不仅鉴定出脑部几乎所有重要的代谢物,还绘制了包含神经递质、嘌呤,有机酸,多胺,胆碱、碳水化合物和脂类等20条通路的代谢网络,并使用这种代谢网络映射质谱成像方法解析了东莨菪碱致大鼠记忆功能障碍模型脑的代谢变化,为***系统疾病的***提供新的信息和见解。江苏植物冷冻切片与空间代谢组学

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