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吉林空间代谢组学 中药活性成分

来源: 发布时间:2023年03月29日

空间代谢组的成像。生成空间代谢组谱图和拉曼相关图,从而能够将振动光谱检测到的结构特征分配给通过质谱检测到的单个分子物种(图3D,E)。一般说来,数据显示了与多种不同脂质相关的拉曼振动峰之间的高度相关性。由于可以获得很好的相关性,作者随后对拉曼光谱和质谱进行了PLS多元回归。用作为例子,作者回归了m/z844.52pC(38:6)的拉曼光谱。回归载体显示高度特异的脂峰,表明对磷脂酰胆碱具有特异性(图3F)。回归分析表明,可建立高度线性关系(校正R2=0.825)(图3G)。假设在一级近似下质谱与浓度的线性关系,这个基于拉曼的模型可以作为复杂组织中特定脂质种类的预测因子。这些结果**了使用基于结构和生物分子信息的互补光谱模式的脂肪组谱的新证明。定量和定位分析,结合生物信息学分析,发展为空间代谢组学方法。吉林空间代谢组学 中药活性成分

如空间代谢组。研究中开发了一种新的基于拉曼光谱和空间代谢组学分析的脂质组学(HSL)成像策略,用于分子表征和定量再髓鞘形成,并通过特定髓鞘蛋白的免疫标记进行了验证。利用拉曼和空间代谢组学数据生成了分子成像图谱,用于体外组织的生物分子结构和组成的关联。将相关脂质组成像方法应用于局灶性脱髓鞘小鼠模型和多发性硬化症死后脑标本的髓鞘再分化研究。发现不仅在脱髓鞘脑组织和正常脑组织之间,在有髓鞘组织和正常有髓组织之间,脂质成分皆存在差异。四川空间代谢组学鹿明空间代谢组学所解决的科研问题。

研究表明,MYC对磷脂酰肌醇(PI)代谢具有组织特异性。作者通过空间代谢组学检测到RCC和T-ALL中,MYC可逆地降低了PI;但在LC和HCC中,MYC反而增加了这些物质(图 7)。可能是由于肺表面富含PG和PI,MYC才会增加了LC中的PI含量。作者推断,MYC通常能够增加PGs含量,但以组织特异性方式差异调节其他GPs,如PIs。***作者对脂肪生成在MYC诱导的**发生中的作用进行了探究,通过空间代谢组学、IHC和Western Blot等方法证明通过体外抑制FA合成可以抑制MYC诱导的脂肪生成,从而抑制了RCC、HCC和BCL的增殖(图 8)。

获取空间代谢组学图像。计算了负离子和正离子模式下的平均空间代谢质谱(图5D,G)以及平均差谱,以突出不同样品的空间代谢质谱之间的差异(图5E,H)。制作的图像显示了属于注射侧(红色)或非注射侧(绿色)的后验概率。该分析基本证实了拉曼光谱特征,与对侧正常侧(非注射侧)相比,再髓鞘损伤(注射侧)发生了高度特异性的分子变化,尤其是正离子模式(图5F,I)。随后通过串联质谱法确认了区分胼胝体再髓鞘化和正常髓鞘化区域的*****峰,并在表1中报告。拉曼光谱和空间代谢组学表明,再髓鞘化区域的脂质成分不同于原始髓鞘的脂质成分。从小鼠模型获得的结果证明了HSL成像可以有效地研究再髓鞘化病变的脂质分布,这是脱髓鞘后新形成的髓鞘与正常髓鞘相比具有明显的分子特征和相对脂质成分差异的***个直接指标。空间代谢组相关技术服务,经验丰富。

2021年9月30日,国家自然科学基金委员会发布的《关于发布生命科学部2021年度指南引导类原创探索计划项目指南的通告》中,也表达了对于空间多维组学的资助支持。2021年11月推出的“鹿明空间代谢组千万医学支持计划(***期)”获得了许多科研工作者的关注及参与。现正式推出“鹿明空间代谢组千万医学支持计划(第二期)”。本次“鹿明空间代谢组千万医学支持计划(第二期)”采用的AFADESI空间代谢组平台,是基于中国医学科学院药物研究所再帕尔•阿不力孜教授与贺玖明教授团队经过十年精心打磨,自主研发成功的AFAI-MSI仪器平台。《鹿明生物空间代谢组学千万医学支持计划。甘肃药物空间代谢组学

《空间代谢组科研应用手册》是一本集聚空间代谢组学的由来、发展、原理及应用的科研专业读物。吉林空间代谢组学 中药活性成分

空间代谢组学研究作者对P493-6B细胞淋巴瘤系(BCL)进行了全基因组表达谱、核突变和ChIP分析,发现MYC诱导增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相关蛋白在内的脂肪酸(FA)合成基因的mRNA表达,在MYC诱导的肝细胞*(HCC)、急性白血病(T-ALL)和肾细胞*(RCC)的三种体内转基因小鼠模型中也有类似表达。还发现MYC与这些FA合成基因的启动子结合并启动mRNA转录,如甲羟戊酸和胆固醇途径基因的启动子。为了了解MYC和SREBP1之间的相互作用,作者首先,对这两种蛋白进行ChIP和re-ChIP分析,证明MYC和SREBP1都可以发现与FA合成基因启动子中的相同DNA分子结合(图1)。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表达,但不降低MYC基因的表达。其次,ChIP的MYC与启动子结合,不仅调节FA合成基因的表达,还调节糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表达。因此,MYC似乎会依次调节参与脂质合成的基因:首先诱导葡萄糖和谷氨酰胺,然后诱导FA合成相关基因。通过RNA测序(RNA-seq)发现,增加MYC水平会引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成。吉林空间代谢组学 中药活性成分

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