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浙江作物代谢组学

来源: 发布时间:2022年10月20日

尿液代谢组学研究案例,空气中PM和生物气溶胶共同暴露的尿液代谢组学特征采用LC-MS+GC-MS双平台代谢组学方法对尿液样品进行分析,其中GC-MS检测102种代谢物,LC-MS检测到1271种。作者通过使用亚组来分析差异代谢物是否具有性别或季节性,结果表明性别和季节对本研究的结果没有明显的混杂影响。差异分析表明,Pu1和Po1之间的差异代谢物数量大于Po1和C之间的差异,LC-MS分析比GC-MS分析检测到更多的差异代谢物,体现出不同平台的检测特点。为了确定尿液中与空气污染PM暴露相关的代谢生物标志物,使用综合分析获得候选差异代谢物,其中C-Po1和Po1-Pu1比较中的重叠差异代谢物作为短期PM暴露相关标志物,确定了33种与短期暴露于空气污染相关的差异代谢物,包括8种脂质、6种核酸、7种氨基酸及其衍生物、3种葡萄糖和9种其他代谢物。KEGG通路分析表明,***富集到5种代谢通路,与免疫、炎症、人类的环境压力、缺血和缺氧有关。读懂代谢组学 代谢组学的研究范畴。浙江作物代谢组学

代谢组学研究:浙江省农科院农产品质量营养所风险评估研究团队联合浙江工业大学在农药联合暴露效应机制研究中取得新进展,作者:杨桂玲,王彦华,李健,王豆,鲍志伟,王强(通讯作者),靳远详(共同通讯作者),在Journal of Hazardous Materials期刊发表了题为“Health risks of chlorothalonil, carbendazim, prochloraz, their binary and ternary mixtures on embryonic and larval zebrafish based on metabolomics analysis”的研究成果,通过代谢组学+转录组学的多组学整合分析技术来阐明几种杀菌剂或其混合物在斑马鱼早期发育阶段的复杂病理生理和毒性通路。浙江作物代谢组学代谢组学-鹿明生物-欧易生物 以生物体内所有代谢产物为研究对象。

GC-MS非靶向代谢组学等研究方法:2021年10月,广东石油化工大学环境科学与工程学院孙建腾教授课题组在《Chemosphere》期刊发表的题为“Metabolomic analysis and oxidative stress response reveals the toxicity in Escherichia coli induced by organophosphate flame retardants tris (2-chloroethyl) phosphate and triphenyl phosphate”的研究成果,通过GC-MS非靶向代谢组学等研究方法,发现包括糖酵解/糖异生、磷酸戊糖代谢、嘌呤代谢、谷胱甘肽代谢、胺素代谢,丙氨酸和天冬氨酸等代谢途径被破坏。大多数差异表达的代谢物被下调,表明有机磷阻燃剂对代谢功能和关键代谢途径有抑制作用。本研究揭示了生物中有机磷阻燃剂对环境产生的风险提供了新的见解。

GC-MS非靶向代谢组学研究,2022年2月,上海市农业科学院食用菌研究所鲍大鹏研究员课题组在《Frontiers in Microbiology》期刊发表的题为“Oxidative Stress and Autophagy Are Important Processes in Post Ripeness and Brown Film Formation in Mycelium of Lentinula edodes”的研究成果,通过iTRAQ标记定量蛋白组学、GC-MS非靶向代谢组学等技术对香菇菌丝进行定量蛋白质组学和代谢组学分析,发现氧化应激和自噬是香菇菌丝后熟转色重要过程,并对其在蛋白质组和代谢组水平上的分子机制有了新的认识。中文标题:氧化应激和自噬是香菇菌丝后熟转色形成的重要过程发表期刊:FrontiersinMicrobiology影响因子:5.64作者单位:上海市农业科学院食用菌研究所涉及的欧易/鹿明生物服务产品:iTRAQ标记定量蛋白组学、GC-MS非靶向代谢组学。聚焦于代谢产物研究,采用高精尖的分析仪器,对细胞内的代谢物进行定性和定量分析。

非靶向GC-MS代谢组学、LC-MS代谢组学研究标题:中国浓香白酒生产过程中人工窖泥中原核生物群落的结构和功能变化研究对象:浓香白酒、人工窖泥期刊:mSystems影响因子:6.469发表时间:2020年3月合作单位:四川省农业科学院水稻高粱研究所运用欧易/鹿明生物技术:TMT标记定量蛋白质组学、PRM靶向验证、非靶向GC-MS代谢组学、LC-MS代谢组学、16SrRNA测序,本篇非靶向代谢组学分析共鉴定出7,478种代谢物。GC-MS代谢组学和LC-MS代谢组学方法在OP***A中均可明确分离批次(图5a至d)。在第四批人工窖泥样品中,分别上调和下调了491和523种代谢物。差异代谢产物被分为16个功能类别(图5f)。脂质和类脂质分子(38.07%)**多,其次是有机杂环化合物(16.17%)和有机酸及其衍生物(13.11%)。代谢组学 生物标志物挖掘**-欧易生物。浙江作物代谢组学

代谢组学真正反映业已发生得变化。浙江作物代谢组学

代谢组学数据提供了COVID-19患者各阶段循环代谢物特征的综合观点,并确定了葡萄糖代谢和尿素循环的代谢重编程是COVID-19的潜在病理机制。在****病程的不同阶段,靶向宿主代谢可能是一种可行的方法。非靶向代谢组学分析中,发现队列中的样品共鉴定出2466个代谢物峰,负离子模式631个、正离子模式下的1835个;通过筛选,鉴定出240种代谢物。轻症组的代谢物与正常组部分重合,而重症组和恢复组很容易区分(图1B)。240个代谢物中有193个与COVID-19***相关(图1C)。火山图显示了不同组代谢物与正常组相比上调下调的情况(图1D);与正常组对比,***上调的代谢物:轻症组有48个,严重组有59个,恢复组有64个;***下调的代谢物:轻症组有33个,重症组有29个,恢复组有34个。使用靶向代谢组学分析;首先根据发现队列中59名受试者的血清代谢物(4个样本因体积小而被排除);定量到了199种代谢物。根据不同组的浓度,将199个代谢物分为16个簇;然后根据恢复组的代谢物是否恢复到正常水平将这些簇分为三组。浙江作物代谢组学

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