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广东宏蛋白组学

来源: 发布时间:2022年08月02日

通过蛋白质组学质谱鉴定、PRM靶向鉴定、iTRAQ标记定量蛋白组学等研究方法,发现了N-豆蔻酰化在肝脏**发生中发挥重要作用,揭示了NMT1的N-豆蔻酰化抑制抗**发生的NDP,并通过干扰泛素化来刺激促**发生的NUP机制。为靶向N-豆蔻酰化和NMT1可能有助于***肝*提供了理论依据。中文标题:NMT1依赖于POTEE发生N-豆蔻酰化并通过差异调节靶标的泛素化来刺激肝脏**的发生研究对象:细胞、小鼠、人**组织发表期刊:FrontiersinOncology影响因子:6.244发表时间:2021年5月合作单位:上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心运用生物技术:iTRAQ标记定量蛋白组学、PRM靶向验证、质谱鉴定、qRT-PCR、IHC、WB、IP文章中iTRAQ标记定量蛋白组学由欧易/鹿明生物提供技术支持单细胞蛋白组学之质谱流式细胞技术。广东宏蛋白组学

随着质谱技术的飞速发展,特别是离子淌度的引入,增加了一个新的分离维度,将蛋白质组研究推进到全新的“4D蛋白质组”层面,打破了基于质谱的蛋白质组学研究的瓶颈,大幅度的提高扫描速度和检测灵敏度,带来蛋白质组学在鉴定深度、检测周期、定量准确性等性能的***提升,可以更好的解决大队列、复杂体系以及微量样本的检测。相比于timsTOF Pro,timsTOF Pro 2 配备了***一代双TIMS分析器,离子容量可提高三倍。经过简化的离子透镜比较大限度地提高了离子传输效率和灵敏度,为4D-多组学建立了新的标准。CCS 值的加入让组学结果更精细,也使timsTOF Pro 2成为转化组学应用不可或缺的工具。timsTOF Pro 2 能够实现少量细胞群或生物穿刺样本等低样本量的蛋白组定量分析以及磷酸化蛋白质组学分析,在短梯度下实现蛋白深度覆盖。浙江高通量蛋白组学TMT/iTRAQ标记定量蛋白组学 差异表达蛋白质组分析研究。

4D蛋白质组学:2022年3月,牛津大学Julian C. Knight教授课题组在cell发表的题为“A blood atlas of COVID-19 defines hallmarks of disease severity and specificity”的研究成果,通过4D蛋白质组学、转录组技术、流式技术、单细胞测序技术等研究方法,为不同COVID-19严重程度的患者提供了一个综合的多组图谱,并将其与流感和败血症患者与健康志愿者进行了综合比较,将支持未来的COVID-19药物开发、临床试验设计和个性化药物方法。中文标题:COVID-19的血液图谱定义了疾病严重程度和特异性的特征研究对象:血液发表期刊:Cell影响因子:41.582发表时间:2022.3运用生物技术:4D蛋白组学技术

作者通过泛素化蛋白组学分析鉴定了茶树作根中的泛素化蛋白质。中文标题:氮调节茶树根中茶氨酸和黄酮类化合物的生物合成:多组学分析揭示的蛋白质水平调节研究对象:茶树根发表期刊:JournalofAgriculturalandFoodChemistry影响因子:5.279发表时间:2021年9月1日发表单位:安徽农业大学运用生物技术:TMT蛋白质组学、泛素化蛋白质组学(其中部分数据分析由鹿明生物提供技术支持)。本文分析了氮缺乏下茶树根部的茶氨酸和黄酮类代谢,通过蛋白质组和泛素化蛋白质组结合转录组数据探索了调节机制。本文的多组学数据整合分析思路值得借鉴。蛋白组学方案为组学研究涉及的样本获取,前处理,数据采集到分析的各个环节提供自动化。

作者进行了综合分析,将蛋白组学和代谢组学中的***生物标志物合并到通路分析中,并确定了半乳糖代谢、戊糖和葡萄糖醛酸盐相互转化、柠檬酸盐循环和**酸代谢这几种途径。然后结合蛋白质和代谢标志物来预测DKD状态。五种机器学习模型表明,组合模型提高了DKD预测的准确性和稳定性。图中展示了RF的结果。总的来说,组合多组学标志物模型是一种强有力的提高DKD诊断的方法。1.蛋白组学结果表明,α2-巨球蛋白、组织蛋白酶D和CD324可作为检测DKD进展的潜在生物标志物。2.代谢组学结果表明,半乳糖代谢和甘油脂代谢是DKD的主要代谢途径,此外甘油-3-半乳糖苷可作为预测DKD的**标志物。3.蛋白组学和代谢组学的组合可以提高预测和诊断DKD的准确性和稳定性。血清综合组学的生物标志物可用于DKD的预警和诊断。该研究为优化DKD的管理提供了数据资源。蛋白质组学,Label Free/iTRAQ/dia/MRM/PRM。山东蛋白组学测序样品准备

单细胞蛋白组学之质谱流式细胞技术 。广东宏蛋白组学

TMT蛋白质组学探究案例:2021年9月,安徽农业大学张照亮教授课题组在Journal of Agricultural and Food Chemistry期刊发表了题为“Nitrogen-Regulated Theanine and Flavonoid Biosynthesis in Tea Plant Roots: Protein-Level Regulation Revealed by Multiomics Analyses”的研究成果,通过TMT蛋白质组学和泛素化蛋白质组学研究方法,发现了氮缺乏条件下茶树根部响应的差异表达蛋白和泛素化蛋白质,为茶氨酸和黄酮类生物合成的调控提供了新的见解,为茶树翻译后修饰调控次生代谢的研究提供了理论依据。广东宏蛋白组学

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