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江苏定量蛋白组学研究进展

来源: 发布时间:2022年08月01日

单细胞蛋白组学研究方法:2020年9月,加州大学的MinnieM.Sarwal课题组在FrontiersinMedicine发表的题为“Near-Single-CellProteomicsProfilingoftheProximalTubularandGlomerulusoftheNormalHumanKidney”的研究成果,通过单细胞蛋白组学研究方法,分析正常人近端肾小管和肾小球区域的肾脏细胞,研究为解开急性和慢性肾脏疾病病因和肾脏亚细胞功能扰动提供依据。中文标题:正常人肾脏近端肾小管和肾小球的单细胞蛋白质组学分析研究对象:人体肾脏组织发表期刊:FrontiersinMedicine影响因子:5.091发表时间:2020年9月运用重点组学技术:单细胞蛋白质组学技术蛋白组学问题解答知乎都做不到哦。江苏定量蛋白组学研究进展

作者使用通过单细胞蛋白组学产生的数据来观察在肾小球细胞或近端肾小管中***丰富的蛋白质细胞。208个Glom富集区蛋白富含囊泡中间运输和细胞成分组织调节作为其**重要的生物学过程,细胞骨架蛋白结合和肌动蛋白结合是**重要的分子功能,肌动蛋白细胞骨架是**丰富的细胞成分。富含247个PT的蛋白质主要集中在小分子代谢过程和药物代谢过程中。在**重要的分子功能中,这些蛋白质的氧化还原酶活性和催化活性丰富。*在GLOM切片中发现的67种蛋白质中,有41种已被报导存在于肾脏中,在这41种蛋白质中,18种(43.9%)与单细胞蛋白组学结果一致,23种(56.1%)在GLOM中与小管相比没有增加。北京转录组学和蛋白组学蛋白组学检测一个样多少钱。

TMTpro-16plex等标记试剂已经发布一年,广受科研工作者喜爱。但是,对于6组3重复、3组6重复的实验设计,16plex却难以满足。TMTpro™ 18-plex标记蛋白组会是更好的选择方式。其中基于质谱仪平台的蛋白组学近年来备受青睐,稳定同位素标记策略也被广泛应用于多重定量蛋白质组学中。鹿明生物推出Thermo Scientific™ TMTpro™ 18-plex标记蛋白组,18个样本以内,可实现一次标记和分级,避免了多批次标记引入的批次效应,能***提升样本的数据质量。同时对更多蛋白质鉴定和定量,提供了样本的多通路处理水平。这个技术可谓是2021年的又一创新技术。

作者运用iTRAQ标记定量蛋白组学对种子发育过程中蛋白质表达的定量比较,同时进行GO和KEGG通路富集分析。结果表明所有鉴定的蛋白被分为29类,主要涉及翻译和碳水化合物代谢。并且作者绘制了p值小于0.01的前20条KEGG通路的气泡图。在三对比较中,普遍富集的途径包括脂肪酸降解、苯丙素生物合成和脂肪酸代谢。其中,参与α-亚麻酸代谢的DAPs在S3 vs. S1组和S4 vs. S1组中都非常活跃。为了评估转录组和蛋白质组之间的一致性,以及了解转录后的mRNA在蛋白质水平上是如何表现的,作者进行了RNA-seq和iTRAQ分析的联合分析。证明DEGs和DAPs参与类黄酮的生物合成和脂肪酸代谢。蛋白组学方案为组学研究涉及的样本获取,前处理,数据采集到分析的各个环节提供自动化。

中文标题:肉桂酸和肉桂醛改善肝葡萄糖脂代谢的机制:多组学提供的见解研究对象:小鼠发表期刊:FrontiersinNutrition影响因子:6.576发表时间:2022年1月11日合作单位:北京中医药大学健康培养教育部重点实验室,北京中医药大学健康栽培北京市重点实验室,北京中医药大学科学技术系运用组学关键技术:转录组学、DIA蛋白组学、PRM靶向蛋白验证(皆由欧易/鹿明生物提供技术支持)。目前,改善饮食被认为是**安全有效的***和预防代谢性疾病的方法,其中肉桂(主要是肉桂属植物八角肉桂和桂皮)及其成分被证明具有多种***作用,包括抗糖尿病、减轻体重、低脂血症和增强胰岛素敏感性。因此,使用膳食补充剂和来自肉桂的化学物质来控制血糖和血脂可能成为***代谢类疾病的新方法。蛋白组学翻译后修饰筛选,检测,鉴定,定性,定量。江西蛋白组学测序后通路分析

蛋白质组学,Label Free/iTRAQ/dia/MRM/PRM。江苏定量蛋白组学研究进展

综上所述,本研究应用RNA-seq转录组分析结合iTRAQ蛋白质组学技术,探讨油茶种子不同成熟期储量积累的动态变化。此外,作者还探讨了黄酮类化合物和脂肪酸的生物合成和代谢可能的调控机制。许多功能转录本(16530)和蛋白质物种(1228)的模式发生了***变化,其中317个DAPs被转录组结果覆盖。结合结构基因(蛋白)或转录因子的表达谱及相应化合物的含量,对重要代谢产物的调控网络进行了探讨。结果表明,黄酮类化合物的合成能力在种子成熟过程中逐渐减弱,而脂肪酸的合成能力则先升高后下降。江苏定量蛋白组学研究进展

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