蛋白质组学研究方法研究案例：2021年10月，中国科学院上海营养与健康研究所武爱波研究员课题组在Ecotoxicology and Environmental Safety发表了题为“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果，通过转录组学和蛋白质组学研究方法，探究了脱氧雪腐镰刀菌烯醇（DON）对成肌细胞分化的影响，发现了DON处理使得细胞骨架蛋白和细胞外基质蛋白表达下调，并抑制ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信号通路的机理，为食品和饲料污染的防治提供了理论依据。单细胞蛋白组学之质谱流式细胞技术 。北京蛋白组学 公司
通过蛋白质组学+转录组学研究方法，发现大黄素引发外泌体通过抑制代谢通路来减少肺泡巨噬细胞的活化和改善肺部炎症的特征，探究了外泌体在参与炎症相关***损伤中的重要作用，为大黄素可以通过减少胰腺外泌体介导的肺泡巨噬细胞活化来减轻严重急性胰腺炎相关的急性肺损伤提供依据。中文标题：大黄素通过抑制胰腺外泌体介导的肺泡巨噬细胞活化减轻严重急性胰腺炎相关的急性肺损伤研究对象：大鼠血浆外泌体发表期刊：ActaPharmaceuticaSinicaB影响因子：11.413发表时间：2021年10月合作单位：四川大学华西医院运用生物技术：TMT标记定量蛋白组学（由欧易/鹿明生物提供技术支持）、转录组学广东蛋白组学实验室蛋白组学研究组织,血液,植物,尿液,动物,细胞样品,酵母,微生物.。
蛋白组学研究实用案例：东南大学医学院院长刘必成教授领导的肾脏病研究所在Science advances期刊发表了题为“Extracellular vesicle–encapsulated IL-10 as novel nanotherapeutics against ischemic AKI"的研究成果，通过蛋白组学+多层组学研究方法，建立IL-10细胞囊泡高表达模型的构建，提出并验证了IL-10细胞外囊泡的靶向缺血性肾损伤的假说，探究了IL-10细胞外囊泡作为新型纳米药物的机理。中文标题：细胞外囊泡包裹的IL-10作为抗缺血性急性肾损伤的新型纳米疗法研究方向：新药研发及其机制研究发表期刊：Scienceadvances影响因子：14.136发表单位：中国南京东南大学附属中大医院肾内科运用生物技术：LC-MS/MS蛋白组学（由鹿明生物提供技术支持）
文章使用TMT标记定量蛋白质组学的方法，分析鉴定了差异表达的蛋白质，对下调的蛋白质进行基因本体论(GO)分析，显示下调参与线粒体电子传递链（ETC）的途径富集，证明了TM处理特别影响了具有较高细胞内铜水平的SOX2/OCT4+细胞中的线粒体ETC途径。确定TM介导的铜依赖性线粒体复合物IV失活是SOX2/OCT4+群体中的主要代谢缺陷。研究结果确定了铜-代谢-转移轴，并强调了其作为高危TNBC患者的下一代治疗方法的潜力。蛋白质组学分析确定了富含线粒体功能的途径。细胞色素c氧化酶 (Complex IV) 是一种线粒体金属酶，是线粒体ETC的终末酶。label free蛋白组学蛋白质组学原理。
本研究采用串联质量标签（TMT）标记的蛋白质组学和平行反应监测（PRM）技术，对莲子脱水过程中的生理调控网络进行了深入研究表明，碳水化合物代谢（包括糖酵解/糖异成、半乳糖代谢、淀粉和蔗糖代谢、磷酸戊糖途径和细胞壁组织）、ER中的蛋白质加工、DNA修复和抗氧化事件对莲种胎脱水有积极的反应。在莲种胚脱水过程中，非酶促抗氧化剂和戊糖磷酸和维生素E作为主要的抗氧化剂，在脱水过程中维持荷花胚胎的REDOX平衡。这些结果为揭示荷花胚胎脱水保护机制的生理学调控网络提供了酶途径在抗氧化保护中起着主要作用。应激生理学检测表明，H2O2是诱发氧化应激损伤的主要活性氧（ROS）成分，谷胱甘肽新的见解。TMT/iTRAQ标记定量蛋白组学 差异表达蛋白质组分析研究。内蒙古糖蛋白组学
研究机构,提供蛋白组学联合分析,技术咨询服务。北京蛋白组学 公司
运用生物技术：TMT标记定量蛋白质组学、PRM蛋白靶向验证由鹿明生物提供技术支持：2021年12月，上海交通大学张荻课题组在Frontiers in Plant Science发表题为 TMT-Based Quantitative Proteomic Analysis Reveals the Physiological Regulatory Networks of Embryo Dehydration Protection in Lotus(Nelumbo nucifera)的研究成果，通过TMT标记蛋白质组学和平行反应监测蛋白靶向验证(PRM)技术研究方法，构建了莲花胚胎脱水保护的生理调控网络。为揭示荷花种子长寿的脱水保护机制提供了新的见解。北京蛋白组学 公司
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