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辽宁代谢组学与蛋白组学

来源: 发布时间:2022年06月23日

本文为中国科学院海岸带研究所赵建民课题组在ScienceoftheTotalEnvironment期刊发表了的文章,通过iTRAQ标记定量蛋白质组学研究弧菌***加剧了海洋酸化造成的牡蛎免疫抑制效应。海洋酸化可能增加海洋软体动物疾病加剧的风险。从而将产生重大的经济和生态影响,因此本研究结果具有重要的指导意义。在本研究中,研究者将太平洋牡蛎暴露于酸化海水(约2000ppm)中28天,然后用金氏弧菌进行***处理,以此研究海洋酸化是否会影响牡蛎对病原菌***的免疫反应。此外,利用基于iTRAQ的定量蛋白质组学方法,对牡蛎鳃这一潜在的造血部位进行了研究,以分析对OA和金氏弧菌共同作用较敏感的生理过程。蛋白质组学-鹿明生物丨欧易生物。辽宁代谢组学与蛋白组学

蛋白组学技术可以提供细胞状态和调控的功能信息,本研究建立了单细胞蛋白组学方法,实现了高灵敏度的蛋白组学检测。该技术有助于揭示疾病的发病机制,探讨预后和风险相关的不同肾脏疾病亚型中的蛋白组学异质性和独特的蛋白标志物,为药物靶点***提供希望。大规模单细胞分析对于捕获复杂细胞系统中的生物异质性至关重要,但*基于RNA技术的单细胞转录组学数据并不能很好地**蛋白质水平上的变化。而单细胞蛋白组学技术能够从蛋白质水平上破译细胞机制并且获得更多的信息。安徽医学蛋白组学走近蛋白组学之蛋白组学常见问题答疑解惑。

通过磷酸化蛋白质组定量鉴定了1244个磷酸化蛋白质,其中474个(38%)在**组织中***增加,183个(15%)***下降。三种蛋白亚型中磷酸化蛋白组学的比较结果揭示了亚型特异性的活性激酶。进一步对差异改变的磷酸化位点的研究显示,在S-I中观察到参与黏附的底物升高和参与RNA转运的底物减少。而基于timsTOF Pro离子淌度4D蛋白质组技术,是对蛋白组学+磷酸化组学的双重升级,可实现快速采集、更高的灵敏度和特异性,**临床蛋白质组学在定性数量更多、定量更准确、位点鉴定更精确、样本需求量更低、检测周期更短等性能上***提升,从蛋白质表达和修饰双重角度更好地发挥发掘分子调控机制、发现疾病分子分型以及发掘生物标志物等多重作用。

本研究采用串联质量标签(TMT)标记的蛋白质组学和平行反应监测(PRM)技术,对莲子脱水过程中的生理调控网络进行了深入研究表明,碳水化合物代谢(包括糖酵解/糖异成、半乳糖代谢、淀粉和蔗糖代谢、磷酸戊糖途径和细胞壁组织)、ER中的蛋白质加工、DNA修复和抗氧化事件对莲种胎脱水有积极的反应。在莲种胚脱水过程中,非酶促抗氧化剂和戊糖磷酸和维生素E作为主要的抗氧化剂,在脱水过程中维持荷花胚胎的REDOX平衡。这些结果为揭示荷花胚胎脱水保护机制的生理学调控网络提供了酶途径在抗氧化保护中起着主要作用。应激生理学检测表明,H2O2是诱发氧化应激损伤的主要活性氧(ROS)成分,谷胱甘肽新的见解。蛋白验证新技术-PRM,平行反应监视蛋白组学。

作者通过泛素化蛋白组学分析鉴定了茶树作根中的泛素化蛋白质。中文标题:氮调节茶树根中茶氨酸和黄酮类化合物的生物合成:多组学分析揭示的蛋白质水平调节研究对象:茶树根发表期刊:JournalofAgriculturalandFoodChemistry影响因子:5.279发表时间:2021年9月1日发表单位:安徽农业大学运用生物技术:TMT蛋白质组学、泛素化蛋白质组学(其中部分数据分析由鹿明生物提供技术支持)。本文分析了氮缺乏下茶树根部的茶氨酸和黄酮类代谢,通过蛋白质组和泛素化蛋白质组结合转录组数据探索了调节机制。本文的多组学数据整合分析思路值得借鉴。蛋白组学技术对肾错构瘤尿液差异蛋白的研究。安徽医学蛋白组学

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DIA蛋白组学:SAPHO综合征是一种侵犯皮肤和骨骼的炎症性疾病,其发病率低,表现形式多样,诊断困难。2022年1月,由北京中医药大学课题组在J Proteomics.期刊发表的题为“Complement system deregulation in SAPHO syndrome revealed by proteomic profiling”的研究成果,通过DIA蛋白组学研究方法,***揭示了SAPHO患者的血清蛋白质组谱,为疾病诊断提供了潜在的生物标志物。同时作者发现补体系统抑制剂如CFH和C4BP在SAPHO综合征中表达上调,这可能在SAPHO综合征的发病机制中发挥重要作用。辽宁代谢组学与蛋白组学

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