通过蛋白质组学分析检测了经M-Exos处理的HBMECs的改变。外泌体***了HBMECs，在0、24和48小时各种基因的表达增加(图2A)。此外，热图分析揭示了不同表达的功能基因，包括与炎症、细胞增殖、免疫调节和血管生成相关的因素(图2B-E)。时序分析表明，HBMECs中标记基因的上调与炎症因子IL3RA有关，增殖相关蛋白CD40和免疫调节因子TNFRSF10C(图2F-H)。作者主要研究外泌体是否促进人脑微血管内皮细胞的血管生成能力，因此初步验证了M-Exos***后血管生成相关基因的表达。蛋白质印迹结果显示血管生成相关基因FlK1和ANGPT1的表达明显增强(图2I)。综上所述，结果证实了M-Exos诱导了人脑微血管内皮细胞的功能改变。蛋白质组学,Label Free/iTRAQ/dia/MRM/PRM。安徽蛋白组学 itraq
作者通过泛素化蛋白组学分析鉴定了茶树作根中的泛素化蛋白质。中文标题：氮调节茶树根中茶氨酸和黄酮类化合物的生物合成：多组学分析揭示的蛋白质水平调节研究对象：茶树根发表期刊：JournalofAgriculturalandFoodChemistry影响因子：5.279发表时间：2021年9月1日发表单位：安徽农业大学运用生物技术：TMT蛋白质组学、泛素化蛋白质组学(其中部分数据分析由鹿明生物提供技术支持)。本文分析了氮缺乏下茶树根部的茶氨酸和黄酮类代谢，通过蛋白质组和泛素化蛋白质组结合转录组数据探索了调节机制。本文的多组学数据整合分析思路值得借鉴。广东靶向蛋白组学难做吗蛋白质组学质谱分析蛋白质组学三大基本技术。
文章使用TMT标记定量蛋白质组学的方法，分析鉴定了差异表达的蛋白质，对下调的蛋白质进行基因本体论(GO)分析，显示下调参与线粒体电子传递链（ETC）的途径富集，证明了TM处理特别影响了具有较高细胞内铜水平的SOX2/OCT4+细胞中的线粒体ETC途径。确定TM介导的铜依赖性线粒体复合物IV失活是SOX2/OCT4+群体中的主要代谢缺陷。研究结果确定了铜-代谢-转移轴，并强调了其作为高危TNBC患者的下一代治疗方法的潜力。蛋白质组学分析确定了富含线粒体功能的途径。细胞色素c氧化酶 (Complex IV) 是一种线粒体金属酶，是线粒体ETC的终末酶。
蛋白质组学研究方法研究案例：2021年10月，中国科学院上海营养与健康研究所武爱波研究员课题组在Ecotoxicology and Environmental Safety发表了题为“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果，通过转录组学和蛋白质组学研究方法，探究了脱氧雪腐镰刀菌烯醇（DON）对成肌细胞分化的影响，发现了DON处理使得细胞骨架蛋白和细胞外基质蛋白表达下调，并抑制ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信号通路的机理，为食品和饲料污染的防治提供了理论依据。单细胞蛋白组学之质谱流式细胞技术。
作者通过iTRAQ蛋白质组学技术鉴定敲低NMT1后发生变化的蛋白质。结果鉴定到三种上调蛋白(LXN,RPL29andFAU)和六种下调蛋白（NMT1,MTPN,AHSG,ALB,GON7andTF）（图2A）。作者将这些蛋白质分别命名为N-豆蔻酰化下调蛋白(NDP)和上调蛋白(NUP)。有趣的是，敲低NMT1会减少NDP和NUP的N-豆蔻酰化，而过表达NMT1会诱导NDP和NUP的N-豆蔻酰化（图2B）。在小鼠模型中，敲除NMT1会导致NDP和NUP的去N-豆蔻酰化，这可以通过在肝脏中表达外源性NMT1来部分逆转（图2C）。这些发现表明，尽管NMT1对NDP和NUP的表达起着相反的作用，但NMT1同时刺激NDP和NUP的N-豆蔻酰化。蛋白质组学多组学分析蛋白质组学研究进展。广东靶向蛋白组学难做吗
蛋白组学研究组织,血液,植物,尿液,动物,细胞样品,酵母,微生物.。安徽蛋白组学 itraq
iTRAQ标记定量蛋白组学技术研究方法：2021年7月，海南大学园艺园林学院吴友根教授课题组等在《Horticulture Research》期刊发表了题为“Integrative iTRAQ-based proteomic and transcriptomic analysis reveals the accumulation patterns of key metabolites associated with oilquality during seed ripening of Camellia oleifera”的研究成果，通过RNA测序(RNA-seq)和iTRAQ标记定量蛋白组学技术研究方法，发现了油茶种子成熟过程中与油质相关关键代谢产物的积累模式特征，探究了不同成熟度油茶转录组和蛋白质组谱机理，描绘了海南油茶种子成熟过程的动态变化图谱。为该树种的遗传改良提供了理论依据。安徽蛋白组学 itraq
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