河南空间代谢组学研究意义

空间代谢组学：中文标题：粪便宏基因组和血清代谢组的整合分析揭示肠道微生物组相关代谢物在结直肠*和腺瘤检测的作用研究对象：人粪便、血清、组织发表期刊：Gut影响因子：23.059发表时间：2021年8月发表单位：国家**中心中国医学院科学院**医院运用生物技术：AFADESI-MSI空间代谢组学、LC-MS非靶代谢组、宏基因组、靶向代谢组学空间代谢组学由贺玖明教授团队提供技术支持。结直肠*（CRC）的早期诊断是提高患者生存率的有效方式。目前临床常用的非侵入性和入侵式检测方法因其准确率低或对患者造成伤害，大规模使用仍受限制。因此，发展无创且准确的检测方法变得尤为重要。一文读懂空间代谢组学:DESI-IMS与MALDI-IMS的区别。河南空间代谢组学研究意义

空间代谢组学成像技术则是通过一些原位电离源，如DESI（解吸电喷雾电离源）、MALDI（基质辅助激光解吸电离源），与质谱相联，通过可视化的成像软件，使得被检测到的质荷比根据含量不同通过不同强度的色彩呈现，进而提供化合物“在哪里？”的信息。无需样品处理实时成像——电喷雾电离技术DESI系列比较大的优势就在于无需样品处理，DESI-MSI作为新型敞开式质谱成像技术，其突出的优势是在大气压条件且敞开式环境下，不需要进行复杂的样品前处理和基质辅助，可更真实反映样品表面分子分布特征。云南软骨空间代谢组学鹿明生物空间代谢组学。

本篇为2021年8月，国家**中心中国医学院科学院**医院崔巍研究员与专业多组学技术团队合作在医学一区消化道领域国际期刊《GUT》期刊发表了题的研究成果，通过非靶向代谢组、靶向代谢组以及AFADESI-MSI空间代谢组学(研究方法，整合了宏基因组的数据，发现了可用于腺瘤及结直肠*诊断的代谢标志物，建立的相关预测模型显示出较高诊断准确性，为结直肠*早期诊断奠定坚实基础。在本研究中，作者对血清代谢组学和粪便宏基因组测序的结果进行整合分析，确定了一组与肠道微生物群密切相关的CRC和腺瘤患者的血清代谢物，并基于代谢物研发了肠道微生物组相关血清代谢物 (GMSM) 策略，可准确区分CRC和腺瘤患者（统称为结直肠异常）与正常健康个体。

AFADESI-MSI空间代谢组学分析了对照组和东莨菪碱***的大鼠矢状脑切片，将发现的代谢物***映射代谢网络，并通过代谢组学分析发现空间代谢变化。不仅可以对药物准确定量，还可以检测代谢网络相关的数百种内源性代谢物在大脑特定区域的分布。图5显示了代谢网络中检测到的各种代谢物，以及在不同大脑微区代谢物的明显改变。如图5A所示，找到三种代谢物（N-甲酰基尿氨酸、L-色氨酸和5-羟色氨酸），属于色氨酸代谢途径，意味着东莨菪碱会干扰色氨酸的代谢过程。作者分析了东莨菪碱***组大鼠脑的十个微区，发现脑桥中有16种表达异常的代谢产物，而在大脑皮层中发现了7种。表明在东莨菪碱***下，脑桥和大脑皮层可能是受影响**严重的区域。定量和定位分析，结合生物信息学分析，发展为空间代谢组学方法。

本研究应用空间代谢组学能够客观地识别食管腺*。EA组磷脂富含长链、多不饱和的PGs。并且，遗传学研究表明，这一机制与脂肪酸从头合成有关。这些结果表明，空间代谢组学可以区分恶性食管中的组织类型。在临床应用包括客观诊断和术中切缘评估具有潜在价值。在获得AFADESI平台原创团队全力支持下，截止2021年9月，鹿明生物已经完成共计近千例样本经验，包括心脏、脑、**、肠道、肝脏、肾脏、皮肤等十几种组织样本空间代谢组学检测及分析。

空间代谢组分析测序服务。河南空间代谢组学研究意义

空间代谢组学二维乃至三维的水平,极大拓展了对组学样品信息的认知。河南空间代谢组学研究意义

队列1：收集手术切除的食管腺*（EA）组织和与之匹配的健康食管上皮组织（MHEE）。队列2：收集健康食管上皮组织（来自健康志愿者，HEE）和未经***的食管炎（IEE）、巴雷特化生（BM）、巴雷特增生（BD）和食管腺*（EA）活检样本，用于发现食管腺*发展进程中甘油磷脂的变化，以及队列1的外部验证。样本制备：样本制成冰冻组织切片，并结合H&E染色。研究方法：空间代谢组学；qPCR检测甘油磷脂合成通路中基因的表达；细胞转染沉默ACYL基因；免疫组化用于分析队列1样本中脂肪酸从头合成通路关键酶的表达。河南空间代谢组学研究意义

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