空间转录组（Spatial Transcriptomics）就是将基因的表达情况与关注的组织切片的免疫化学染色图像进行整合，从而将组织内不同细胞的基因表达信息定位到组织的原始空间位置上去，进而直接观测组织中不同部位功能区基因表达的差异。空间转录组技术利用了常规的原位技术和组学技术两方面的优势。目前已发表的关于空间转录组技术有主要有 Spatial Transcriptomics, Slide-seq, LCM-seq, seqFISH, MERFISH, Liver single cell zonation, Geo-seq 和 Tomo-seq, 涉及物种有人、小鼠、果蝇、秀丽隐杆线虫、斑马鱼、拟南芥、杨树和云杉等。Science发表了将组织扩展和原位RNA测序结合起来的新型空间转录组技术ExSeq。甘肃空间转录组是什么
美国脑计划启动的 BICCN 项目，该项目将整合不同类型细胞的分子、解剖学和生理学特性，创建小鼠脑细胞 3D 参考图谱，同时也将基于人类和非人类灵长类脑组织样本，绘制脑细胞参考图谱 ，其涉及空间转录组学技术主要包括 MERFISH 和 seqFISH。一些实现空间转录组学的重要技术，可以追溯到二十世纪七十年代，长期以来，各种形式的原位杂交技术（ISH）已用于可视化空间中的基因表达。从技术原理中不难看出，空间转录组技术重要为特殊的载玻片。四川空间转录组多少钱转录本的空间位置信息可以通过在原位阵列上捕获的组织切片中的转录本来获取， 如空间转录组技术。
1. 10x Genomics空间转录组用于文库构建的每张载玻片上有四个捕获区域，每个捕获区域的大小为6.5x6.5mm，包含5000个被条形码标记的点（barcoded spots），每个点的直径为55 μm，点和点之间中心的距离为100 μm，并且每个点都有一个barcode序列。10X Visium空间转录组的实验主要分为两部分：组织学板块和组学板块。组织学板块包括样品的包埋、切片、固定、染色及成像，记录切片的形态学信息；组学板块包括cDNA的合成、扩增、接头连接和测序，记录切片的转录本信息和空间位置信息 。
空间转录组研究的的必要性。研究单细胞我们想要探究细胞间的异质性，但是常规的单细胞是将细胞解离成单细胞悬液，然后利用单细胞分离技术（微孔，微板，液滴）等方法实现单细胞建库，这里比较大的问题是是细胞失去了原本在组织的空间信息。然而这个空间信息在实际研究中有很重要。特别是在研究细胞命运机制及细胞谱系发生空间位置的信息显得尤为重要，因此发展空间转录组技术实现细胞的位置信息的保留，对研究此类细胞状态尤为必要。了解R语言基础语法及数据类型，了解空间转录组数据分析整体流程。
许多当前时代空间转录组技术的基础都是在自七十年代以来的几十年间建立的。例如，于1976 年首先使用紫外线激光来切割组织。当前流行的技术，例如空间转录组学（ST）和 10X Visium 依靠这种微阵列技术，区别就在于是从放置在微阵列载玻片上的组织上而不是从溶液中来捕获转录本信息。当前时代的空间转录组技术大致分为五类方向：激光显微切割（LCM），单分子荧光原位杂交（smFISH），靶向原位测序（ISS），原位阵列捕获和 其他非成像技术。10x Genomics空间转录组技术可以应用于免疫、发育、神经和病理等研究方向。山西空间转录组多少钱
scRNA-seq 技术的进步启发了利用高分辨率转录组定量分析与空间转录组学数据的互补性质的新方法。甘肃空间转录组是什么
人类细胞图谱项目的主要目标之一是描述所有细胞类型的空间关系。同时基于表达特征对多种细胞类型进行空间映射，有助于研究不同细胞类型之间的相互作用。已经发展了一些策略来检测单细胞分辨率的空间基因表达谱，如Slide-seq、seqFISH或MERFISH。为了更有效地为研究群体探索空间基因表达数据，我们构建了SpatialDB数据库用于空间解析的转录组。
人类细胞图谱项目极大地推动了单细胞水平的生命科学研究。空间转录组学技术的发展和空间基因表达数据的快速积累是未来的发展趋势。我们将继续收集新的技术和数据集来更新SpatialDB。此外，我们将整合更多的工具和数据源来分析数据. 甘肃空间转录组是什么
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