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湖北欧易生物空间转录组质量

来源: 发布时间:2021年12月09日

空间转录组是在组织原位检测基因表达的一种技术,与bulk RNA-seq或单细胞转录组测序相比,空间转录组避免了组织中细胞位置信息的丢失,使得我们在检测基因表达的同时获得基因在组织内部的空间位置信息。已发表的关于空间转录组技术有Slide-seq , LCM-seq , seqFISH, MERFISH , Liver single cell zonation , Geo-seq and Tomo-seq。这些方法或是在细胞数量上限制较大,或是存在有效测序深度不足等问题。正是由于空间转录组可以从多维度解析生物学过程的特点,近年来关于空间转录组无论是在技术开发,还是大规模应用或商业化,都得到蓬勃发展。


研究的***主要集中于人类和小鼠的大脑,而其他***(例如肝脏)的空间转录组学研究相对滞后。湖北欧易生物空间转录组质量

 **近,空间转录组学研究炙手可热。细胞及其在组织样本中的相对位置之间的关系对于理解疾病病理可能至关重要。空间转录组学是一项开创性的技术,它使科学家能够测量组织样本中的所有基因活性,并绘制出发生该活性的位置的图。该技术已经导致了新发现,这些新发现将有助于帮助科学家更好地了解生物过程和疾病。10x Genomics空间转录组技术可以应用于**、免疫、发育、神经和病理等研究方向。欧易生物具有上百例空间转录组项目执行经验,致力通过质量的服务,助力各位科研工作者取得新的突破。浙江欧易生物空间转录组做什么细胞通讯是单细胞研究中一个模拟与理解复杂组织生态系统动力学的适用方法。

10x Genomics空间转录组的实现原理是什么?10x Genomics空间转录组用于文库构建的每张载玻片上有四个捕获区域,每个捕获区域的大小为6.5x6.5mm,包含5000个被条形码标记的点(barcoded spots),每个点的直径为55 μm,点和点之间中心的距离为100 μm,并且每个点都有一个barcode序列。组织切片的细胞中会释放出mRNA,迁移到每个spot的mRNA会被标记上相应的barcode序列,然后进行文库构建并进行测序。根据数据的条形码信息对数据进行分析,以确定哪些数据来自哪个位置,从而实现空间基因表达的可视化。

一些实现空间转录组学的重要技术,**早可以追溯到二十世纪七十年代,长期以来,各种形式的原位杂交技术(ISH)已用于可视化空间中的基因表达。从技术原理中不难看出,空间转录组技术**为特殊的载玻片。ISS 方法通常通过基于连接(SBL)或者基于合成(SBS) 的原位测序, 确定靶向基因序列或非靶向的 cDNA 短片段,**终获得空间转录组信息。根据测序链接策略的不同(SOLiD,cPAL和SEDAL),基于 SBL 的原位测序技术方法的代表性技术分别为 FISSEQ,ISS,STARmap。空间转录组是一种用于从空间层面上解析RNA-seq数据的技术,从而解析单个组织切片中的所有mRNA。

空间基因表达技术能够在保留空间背景信息的同时,多方位测量转录组谱。然而,现有的分析方法并没有解决技术分辨率有限或有效利用空间信息的问题。来自美国的科研团队开发了BayesSpace,这是一种完全贝叶斯统计方法,它使用来自空间邻域的信息来增强空间转录组数据的分辨率并进行聚类分析。BayeSpace通过使用的Bioconductor SingleCellExperiment数据结构将预处理数据作为输入,无缝集成到空间转录组分析工作流中,输出同样存储在SingleCellExperiment对象中,该对象可用于下游分析。欧易生物具有上百例空间转录组项目执行经验,致力通过质量的服务,助力各位科研工作者取得新的突破。作者通过对三个人类脑皮层组织的空间转录组测序,可评估不同脑皮层区域中基因表达特征和细胞类型定位情况。浙江欧易生物空间转录组做什么

研究通过对 ALS 小鼠疾病进程(症状前、发病、症状期和终末期)的脊髓组织进行空间转录组测序。湖北欧易生物空间转录组质量

 空间转录组学(ST)是一种方法,允许在组织样本中可视化和定量分析转录组与空间分辨率。通过在载玻片上排列含有位置条形码的寡核苷酸的组织切片,该方法声称可以生成具有精确位置信息的高质量的RNA-seq cDNA文库。条形码芯片有1007个带有独特条形码序列的引物位点。每个位置都有一个直径100µm(对应于一个组织域)中心到中心的距离是200µm。欧易生物具有上百例空间转录组项目执行经验,在空间转录组样本处理、实验和数据挖掘上的成功经验,致力通过质量的服务,助力各位科研工作者取得新的突破。湖北欧易生物空间转录组质量

上海欧易生物医学科技有限公司总部位于联航路1188号25幢,是一家检验检测服务。(依法须经批准的项目,经相关部门批准后方可开展经营活动,具体经营项目以相关部门批准文件或许可证件为准)一般项目:生物医药产品、生化产品的研发,医药中间体、化工原料及产品(除危险品化学品、监控化学品、易制毒化学品)的研发、销售,仪器仪表的销售,并提供相关技术咨询、技术服务,会务服务,企业管理咨询。的公司。公司自创立以来,投身于科研服务,科研检测,学术研究,技术咨询,是医药健康的主力军。欧易生物继续坚定不移地走高质量发展道路,既要实现基本面稳定增长,又要聚焦关键领域,实现转型再突破。欧易生物始终关注医药健康市场,以敏锐的市场洞察力,实现与客户的成长共赢。

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